R语言读取栅格遥感影像数据的方法

  本文介绍基于R语言中的raster包,读取单张或批量读取多张栅格图像,并对栅格图像数据加以基本处理的方法。

1 包的安装与导入

  首先,我们需要配置好对应的R语言包;前面也提到,我们这里选择基于raster包来实现栅格图像数据的读取与处理工作。首先,如果有需要的话,我们可以先到raster包在R语言的官方网站https://cran.r-project.org/web/packages/raster/index.html)中,查阅raster包的基本情况,比如其作者信息、当前的版本、所依赖的其他包等等;如下图所示。

  当然,这些内容看不看都不影响我们接下来的操作。接下来,我们开始安装raster包;这里我是在RStudio中进行代码的撰写的。

  首先,我们输入如下的代码,从而开始raster包的下载与自动配置。

install.packages("raster")

  随后,按下回车键,运行代码,如下图所示。

  可以看到,我们在安装raster包时,会自动将其所需依赖的其他包(如果在此之前没有配置过)都一并配置好,非常方便。

  接下来,输入如下的代码,从而将刚刚配置好的raster包导入。

library(raster)

随后,按下回车键,运行代码,如下图所示。

  此时,在RStudio右下方的“Packages”中,可以看到raster包以及其所依赖的sp包都处于选中的状态,表明二者都已经配置成功,且完成导入。

2 单一栅格图像读取与处理

  接下来,我们首先开始读取、处理单独一景栅格图像数据。

  首先,我们输入如下的代码;其中第一句是指定接下来要打开的栅格图像的路径与文件名,第二句则是通过raster()函数打开这一栅格图像。

tif_file_name <- r"(E:\02_Project\01_Chlorophyll\ClimateZone\Split\A_LCC0.TIF)"
tif_file <- raster(tif_file_name)

  运行上述代码。此时,我们可以在RStudio中右上方的“Environment”中看到我们刚刚新建的两个变量,以及其对应的值。

  接下来,我们可以直接通过plot()函数,对刚刚读取到的栅格图像数据加以绘制。

plot(tif_file)

  运行代码后,可以在RStudio中右下方的“Plots”看到绘制完毕的图像。可以说,这一绘制栅格图像的方式,相较于PythonC++等语言都更为方便。

  随后,我们简单介绍一下对这一栅格图像数据的处理操作。例如,我们可以通过mean()函数与sd()函数,计算栅格图像全部像元数值的平均值和标准差;这里我们用到了na.rm = TRUE参数,具体含义稍后会提到。

tif_mean <- mean(tif_file[], na.rm = TRUE)
tif_std <- sd(tif_file[], na.rm = TRUE)

  运行上述代码,随后输入如下的代码,即可查看我们刚刚计算得到的平均值与标准差。

tif_mean
tif_std

  结果图下图所示。

  前面我们提到了na.rm = TRUE参数,这一参数表示是否消除数据集中无效值NA的影响;如果我们不将其设置为TRUE,那么就表示不消除数据集中的无效值;而如果我们的栅格图像中出现无效值(NoData值),那么就会使得平均值、标准差等计算结果同样为无效值NA;如下图所示。

3 大量栅格图像读取与处理

  接下来,我们介绍一下基于raster包批量读取大量栅格图像的方法。

  首先,我们需要将存放有大量栅格图像的文件夹明确,并将其带入list.files()函数中;这一函数可以对指定路径下的文件加以遍历。其中,pattern是对文件名称加以匹配,我们用".tif$"表示只筛选出文件名称是以.tif结尾的文件;full.names表示是否将文件的全名(即路径名称加文件名称)返回,ignore.case表示是否不考虑匹配文件名称时的大小写差异。

tif_file_path <- list.files(r"(E:\02_Project\01_Chlorophyll\ClimateZone\Split\0)", pattern = ".tif$", full.names = TRUE, ignore.case = TRUE)

  运行上述代码,并将这一变量打印出来,结果如下图所示。可以看到,此时我们已经将指定路径下的.tif格式的栅格图像全部提取出来了。

  接下来,我们通过stack()函数,将全部栅格图像的数据放入同一个变量中;随后,我们可以打印一下这个变量,查看其中的内容。这里需要注意,如果通过这种方法批量读取栅格图像,需要保证每一景图像的空间参考信息、行数与列数完全一致,否则会弹出报错信息。如果大家的栅格图像行数与列数不完全一致,可以参考文章ArcPy对齐多张遥感影像的像元位置、统一行列号https://www.jianshu.com/p/abbe91acada2),对各个栅格图像加以统一。

tif_file_all <- stack(tif_file_path)
tif_file_all

  运行上述代码,得到如下所示的结果。可以看到,这一变量中保存了12个图层(虽然栅格图像只有7景,但是其中有几景是具有多个波段的);其中,除了最基本的栅格图像维度、空间范围、空间参考信息等内容,names还展示了12个图层各自的名称,min valuesmax values则还展示了每一个图层的最小值与最大值。

  此外,我们还可以继续基于plot()函数,直接批量绘制多个图层各自的栅格图像。

plot(tif_file_all)

  运行上述代码,结果如下所示。

  此外,我们还可以基于mean()等函数,对栅格图像的基本数学统计信息加以计算。不过在对多个栅格图像数据加以计算时需要注意,在tif_file_all后是否添加[]符号,得到的结果是不一样的——如果不添加[]符号,我们相当于是加以逐像元分析,对每一个位置的像元在12个图层中的数值加以统计,并计算该像元在12个图层中的平均值;因此最终所得结果是一景新的栅格图像,图像中的每一个像元数值都表示该像元在12个图层中的平均值。而如果我们添加了[]符号,那么就和前述单一栅格图像的处理一样,计算的结果就是一个数值,即12个图层中每一个像元对应数值的总体的平均值。

tif_all_mean <- mean(tif_file_all, na.rm = TRUE)
tif_all_mean_2 <- mean(tif_file_all[], na.rm = TRUE)

  我们分别打印上述两个变量,得到结果如下图所示。

  由此可以更加明显地看出添加[]符号与否的差异。

  本文就只是对R语言raster包读取、处理栅格数据加以基本的方法介绍,至于更加深入的用法,我们将在后期的文章中加以介绍。

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 203,772评论 6 477
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 85,458评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 150,610评论 0 337
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,640评论 1 276
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,657评论 5 365
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,590评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,962评论 3 395
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,631评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,870评论 1 297
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,611评论 2 321
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,704评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,386评论 4 319
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,969评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,944评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,179评论 1 260
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 44,742评论 2 349
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,440评论 2 342

推荐阅读更多精彩内容