第一步:用conda 安装 SRA-tools
conda install sra-tools
第二步 建立文件夹 存储数据
第三步 数据下载
方法一: fast-dump 下载
nohup fastq-dump -v --split-3 --gzip SRR******* &
nohup fastq-dump -v --split-3 --gzip SRR******* &
nohup fastq-dump -v --split-3 --gzip SRR******* &
写成一个.sh shell脚本 然后 bash一下即可以了。
方法二:prefetch下载 (也是sratools的一个软件)
先要在https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra 下载下来一个SRR_Acc_List.txt
然后 用 nohup prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt & 放后台下载