大家好，我们是中国农业大学动科学院刘剑锋教授团队，致力于分享数量遗传和生物信息等方面的科研知识，这是我们团队的RStudio设置选项系列的第一节内容，即通用设置General，希望能给大家带来帮助~

RStudio设置选项（全）——1.General - b站视频

RStudio版本: RStudio 2022.12.0 Build 353

• 1. General
  • 1.1 Basic
    • 1.1.1 R Sessions
    • 1.1.2 Workspace
    • 1.1.3 History
    • 1.1.4 Other
  • 1.2 Graphics
    • 1.2.1 Graphics Device
  • 1.3 Advanced
    • 1.3.1 Debugging
    • 1.3.2 OS Integration
    • 1.3.3 Other
    • 1.3.4 Experimental Features

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1. General

1.1 Basic

1.1.1 R Sessions

• R version（）:
  R语言版本:

  选择一个电脑上已安装的R语言版本。
  用户可以安装多个不同版本的R语言，RStudio默认选择最新的版本。
  选择R语言版本的同时，安装的第三方包也会根据版本变化。
  按住ctrl键然后鼠标左键双击RStudio快捷方式可在RStudio启动前选择R语言版本。

  R语言版本选择.png

• Default working directory (when not in a project):
  默认工作目录:

  RStudio的启动目录（不在项目中时），将从此目录中读取初始.RData和.Rhistory文件（如果存在）。
  当前工作目录和Files窗格也将设置为此目录。当指定目录不存在时，将设为“文档”所在位置，如"E:/OneDrive/文档"。

  请注意，当使用文件关联（双击打开.R脚本）或带有指示初始工作目录的命令行参数的终端启动RStudio时，可以覆盖此设置。

• Restore most recently opened project at startup
  在启动时恢复最近打开的项目

  打开RStudio时自动重新打开最近使用的项目（如果存在）。

• Restore previously open source documents at startup
  在启动时恢复以前打开的源文档

  打开RStudio时，会自动重新打开以前为当前项目打开的源文件。
  同时上次退出时的变量查看窗口也会保留，无论退出前是否保存了变量.RData。

  恢复源文件和变量查看.png

1.1.2 Workspace

• Restore .RData into workspace at startup
  启动时将.RData还原到工作区

  启动时将在初始工作目录中找到的.RData文件（如果存在）加载到R工作区（全局环境）。
  如果您有一个非常大的.RData文件，那么取消选中此选项将大大缩短启动时间。

• Save workspace to .RData on exit: Ask
  退出时将工作区保存到.RData

  Always: 在退出时始终将工作区保存于.RData文件中
  Never: 在退出时从不保存工作区
  Ask: 在退出时询问是否保存工作区

  请注意，如果在会话结束时工作区未进行任何更改，则即使指定了Ask，也不会出现保存提示。意外退出时，即使指定了Always也不能保存工作区变量。

  保存工作空间.png

1.1.3 History

• Always save history (even when not saving .RData)
  始终保存历史记录（即使不保存.RData）

  确保.Rhistory文件始终与会话中的命令一起保存，即使退出时选择不保存.RData文件。
  意外退出时，即使勾选也不能保存最新的历史命令。

  历史记录窗口.png

• Remove duplicate entries in history
  删除历史记录中的重复条目

  如果命令与最近添加的命令完全相同，则取消将其添加到历史记录中。

  不记录重复命令.png

1.1.4 Other

• Wrap around when navigating to previous/next tab
  在选项卡切换时循环到首个选项卡

  ctrl+Tab快捷键可以在source的选项卡中切换窗口，启动此选项将允许从最后一个选项卡切换到第一个选项卡。

标签循环.png

• Automatically notify me of updates to RStudio
  当RStudio版本更新时自动提醒我

  当检测到RStudio存在新版本时，将在用户打开RStudio新窗口时弹窗提示用户更新。

  更新提示.png

• Send automated crash reports to RStudio
  向RStudio发送软件崩溃报告

1.2 Graphics

1.2.1 Graphics Device

• Backend: (Default)
  作图后端

  Default: 默认，grDevices？
  Windows: Windows系统图形渲染引擎
  Cairo: 用于图形绘图和渲染的免费库，支持复杂的 2D 的绘图功能，支持硬件加速
  Cairo PNG: Cairo PNG
  AGG: Anti-Grain Geometry（AGG）是一个高质量、高性能的二维图形库。"ragg"包提供了一组基于AGG的图形设备，作为通过“grDevices”包提供的光栅设备的替代品

  图片后端.png

• Antialiasing: (Default)
  抗锯齿

  Default: 默认
  None: 无
  Gray: 灰度平滑
  subpixel: 次像素平滑

  请注意：该选项仅在backend选项为Cairo时有效，backend为AGG时自动开启抗锯齿。

  抗锯齿.png

1.3 Advanced

1.3.1 Debugging

• Use debug error handler only when my code contains errors
  仅当代码包含错误时使用调试错误处理程序

  为了让调试器在错误发生的任意时间地点都能启动，Rstudio 会在你的代码不在栈堆的时候不启动调试模式。如果你发现它漏掉了你想捕捉的错误，请取消勾选此选项。

1.3.2 OS Integration

• Rendering engine: Auto-detect (recommended)
  界面渲染引擎

  Auto-detect (recommended): 自动检测（推荐）
  Desktop openGL: OpenGL(Open Graphics Library)
  Software: 使用software

• Use GPU exclusion list (recommended)
  使用GPU排除列表(推荐)

  不使用某些GPU进行渲染。该选项仅在Rendering engine选项为Desktop openGL时有效。

• Use GPU driver bug workarounds (recommended)
  使用GPU驱动bug解决方案(推荐)

• Show full path to project in window title
  在窗口标题中显示项目的完整路径

  若打开一个项目文件夹，勾选此选项将在RStudio窗口顶部标题中显示项目的完整路径，取消勾选则只显示项目文件夹的名称。
  不在某个项目中时，此选项无效，RStudio窗口标题为RStudio。

  显示R项目路径.png

• Use native file and message dialog boxes
  RStudio Desktop是否将使用操作系统的文件打开窗口和消息对话框

  勾选此选项后，RStudio将使用操作系统的文件打开窗口和消息对话框，取消勾选则使用RStudio自带的文件打开窗口和消息对话框。

  文件打开窗口.png

• Disable Electron accessibility support
  禁用Electron辅助功能支持

  RStudio IDE团队正在将RStudio Desktop IDE从一个编程工具包（QtWebEngine）迁移到另一个（Electron）。Electron用于创建许多流行的应用程序，如Visual Studio Code和Slack，并将为RStudio Desktop IDE提供更好的性能、可访问性和可维护性。

  "Spotted Wakerobin" RStudio IDE发行版（2022年7月）包括基于Electron的RStudio IDE预览，面向希望测试新技术并提供反馈的用户。

  基于Electron的IDE将在未来的版本中完全取代QtWebEngine版本，但目前仍处于测试期，若发现RStudio某些功能异常可以尝试勾选次选项，查看错误是否消失。

1.3.3 Other

• Show .Last.value in environment listing
  在环境变量中显示.Last.value

  在环境变量面板中显示用户执行的最后一个R表达式的返回值，该返回值存储在变量名为.Last.value的变量中。

  最后表达式值.png

• Help panel font size:12
  帮助面板字体大小

  RStudio面板右下角（默认位置）的Help窗口中的字体大小。

1.3.4 Experimental Features

• User Interface Language:English
  用户界面语言

  English: 英语
  French(Francais): 法语

后续内容预告：

2. Code
3. Console
4. Appearance
5. Pane Layout
6. Packages
7. R Markdown
8. Python
9. Sweave
10. Spelling
11. Git/SVN
12. Publishing
13. Terminal
14. Accessibility