帕赫贝尔出生于德国的纽伦堡。早年随施韦默尔学习音乐，1669年进入阿尔特多夫的一所学校接受音乐教育，但因支付不起学费，次年转入雷根斯堡的一所学校。1673年至维也纳，成为圣斯蒂芬大教堂管风琴师克尔的学生和助手。1677年至爱森纳赫，担任了一年的宫廷管风琴师。于1678年在爱尔福特担任管风琴师，在这里教授了J.C.巴赫。1681年，帕赫贝尔二十八岁时娶芭芭拉盖布勒（Barbara Gabler）为妻；1683年，巴巴拉和他们唯一的孩子死于瘟疫。隔年他再娶茱笛丝卓默，这一次婚姻为他带来七名子女。离开了艾尔特，帕赫贝尔来到伍腾堡宫廷，这个地方给他很多专业上的自由度，可惜好景不常，1692年秋，因为法国大军入侵，他被迫返回出生地纽伦堡，最后辗转到了戈塔。碰巧出生地纽伦堡的圣塞巴德教堂的原任风琴师，也就是帕赫贝尔的老师魏克过世，让他得以顺利接任老师之职位。他就在这里一直待到他过世。在纽伦堡的五年间，帕赫贝尔写下了感恩赞歌等重要的宗教合唱曲和管风琴赋格，被视为他晚年的代表作。1706年，约翰帕赫贝尔去世，享年52岁。
所以帕赫贝尔从未去过英国，芭芭拉盖布勒（Barbara Gabler）是德国人，死前不但已经嫁给了帕赫贝尔并且还生了孩子。
