1.下载R基础和Rstudio
2.打开Rstudio,设置清华镜像、设置字体款式和大小及背景颜色
3.设置工作目录
注:这点非常重要,必须给不同的项目设置不同的工作目录(相当于用Endnote设置引文数据库,每篇文章的引文数据库不一样)
方法1.设置工作目录用的是 setwd() 指令
- windows: 在桌面新建一个名为 Rdata 的文件夹作为工作目录
然后打开这个文件夹,在地址栏可以看到其路径(看图1),复制其路径,将分隔符\改为/。然后在Rstudio输入以下指令:
setwd(dir="C:/Users/kingjie/Desktop/Rdata") #注意这里的kingjie是生信星球作者的文件夹
图片来自 生信星球
方法2.如下图 【优先推荐此方法】
4.查看工作目录
- 输入指令:getwd()
> getwd()
[1] "/Users/apple/Desktop/SB/Rdata"
5.显示此工作目录下的文件列表
- 输入指令:list.files() 或者 dir()
> list.files()
[1] "Rdata.Rproj"
> dir()
[1] "Rdata.Rproj"
- 在Rdata 目录里新建一个 doudou.txt 后,再输入 dir()
> dir()
[1] "doudou.txt" "Rdata.Rproj"
6.R的基础指令
- 加减乘除、平方、开方、绝对值
> 3+5
[1] 8
> 3-5
[1] -2
> 3*5
[1] 15
> 3^5
[1] 243
> sqrt(9)
[1] 3
> abs(-3)
[1] 3
> log2(8)
[1] 3
> 15/5
[1] 3
- 函数求和
> sum(1,2,3,4,5)
[1] 15
- 赋值:符号 <-
> x<- 1+2
> x
[1] 3
- 删除变量
> a<-3
> b<-1
> c<-4
> u<-5
> ls() #显示当前变量
[1] "a" "b" "c" "u" "x"
> rm(a) #删除变量a
> rm(b,c,u,x) #删除变量b c u x
> ls() #显示当前变量
character(0) #当前变量数为0
> a<-1
> b<-2
> c<-3
> ls()
[1] "a" "b" "c"
> rm(list = ls()) #清空当前所有变量
> ls()
character(0) #当前变量数为0
-
列出历史命令:输入指令 history()
-
清空控制台:键盘按键 control+l
保存数据和绘图函数:输入指令 save.image