今日主题:学习R包
安装和加载R包:
镜像设置:
生信星球推送中的教程很详细,参见此处,最推荐使用其中的第三种方法:配置文件.Rprofile。
安装:
- 存在于CRAN网站的包安装命令 install.packages(“包”)。
- 存在于Bioconductor网站的包安装命令 BiocManager::install(“包”)。
加载:
library(),require(),这两个命令均可。
dplyr包的用法:
五个基础函数:
- 新增列:mutate(数据集,新列=)
- 筛选列:select(数据集,列号or列名)
- 筛选行:filter(数据集,列名的判断条件)
- 按某列或某几列对整个表格进行排序:arrange(数据集,列名) #默认升序排序,用desc(列名)实现降序
- 汇总:summarise(数据集,mean(某列),sd(某列))
两个实用技能:
- 管道操作 %>%:加载任意一个tidyverse包均可使用。
- count 统计某列的unique值:count(数据集,列名)。