聚类算法之K均值算法(k-means)的Python实现

算法简介

K-means算法是硬聚类算法,是典型的基于原型的目标函数聚类方法的代表,它是数据点到原型的某种距离作为优化的目标函数,利用函数求极值的方法得到迭代运算的调整规则。K-means算法以欧式距离作为相似度测度,它是求对应某一初始聚类中心向量V最优分类,使得评价指标J最小。算法采用误差平方和准则函数作为聚类准则函数。

聚类问题

通常,人们根据样本间的某种距离或者相似性来定义聚类,即把相似的(或距离近的)样本聚为同一类,而把不相似的(或距离远的)样本归在其他类。

所谓聚类问题,就是给定一个元素集合D,其中每个元素具有n个可观察属性,使用某种算法将D划分成k个子集,要求每个子集内部的元素之间相异度尽可能低,而不同子集的元素相异度尽可能高。其中每个子集叫做一个簇。

k-means算法是一种很常见的聚类算法,它的基本思想是:通过迭代寻找k个聚类的一种划分方案,使得用这k个聚类的均值来代表相应各类样本时所得的总体误差最小。

算法步骤

  1. 从D中随机取k个元素,作为k个簇的各自的中心。

  2. 分别计算剩下的元素到k个簇中心的相异度,将这些元素分别划归到相异度最低的簇。

  3. 根据聚类结果,重新计算k个簇各自的中心,计算方法是取簇中所有元素各自维度的算术平均数。

  4. 将D中全部元素按照新的中心重新聚类。

  5. 重复第4步,直到聚类结果不再变化。

  6. 将结果输出。

算法实现

import numpy as np
import random
import matplotlib.pyplot as plt

def euclDistance(vector1, vector2):
    '''
    计算两个元素之间的欧氏距离
    '''
    return np.sqrt(np.sum(np.power(vector2 - vector1, 2)))

def initCentroids(dataSet, k):
    '''
    随机生成K个初始质心
    '''
    numSamples, dim = dataSet.shape #得到dataSet的行和列
    index = random.sample(range(numSamples),k) #随机生成K个不重复的实数,返回一个列表。
    centroids = np.array([dataSet[i,:] for i in index]) #创建K个初始质心放在一个数组中
    return centroids

def kmeans(dataSet, k):
    numSamples = dataSet.shape[0]
    clusterAssment = np.zeros((numSamples, 2)) #创建一个numSamples行2列的全零矩阵用于存储元素的所属簇和元素本身
    centroids = initCentroids(dataSet, k) #初始质心
    clusterChanged = True
    while clusterChanged:
        clusterChanged = False
        for i in range(numSamples):
            #遍历每一个元素
            minDistance = float("inf")  #设定元素与质心之间的初始距离为无穷大
            ownGroup = 0 #设定元素初始所属簇
            for j in range(k):
                #计算第i个元素分别与k个质心的距离
                distance = euclDistance(centroids[j, :], dataSet[i, :])
                if distance < minDistance:
                    #把元素归为与质心欧式距离最小的那个簇中
                    minDistance = distance
                    ownGroup = j
            if clusterAssment[i, 1] != ownGroup:
                #判断该元素所属组是否发生变化,若变化了就继续进行循环,直到每个元素所属组不在变化就结束循环
                clusterAssment[i, 1] = ownGroup
                clusterChanged = True
        for j in range(k):
            '''
            遍历完所有元素后更新K个质心
            clusterAssment[:, 1] == j #判断每个元素是否属于j组,是的话就返回True,否则返回False
            np.nonzero(clusterAssment[:, 1] == j)[0] #返回一个有两个元素的tuple,第一个元素是这个数组(元素是布尔值的形式)中元素是True的下标
            dataSet[np.nonzero(clusterAssment[:, 1] == j)[0]] #得到属于某个组的全部元素
            np.mean(pointsInCluster, axis=0) #计算每一个簇中所有元素的均值作为各自簇的新的质心
            '''
            pointsInCluster = dataSet[np.nonzero(clusterAssment[:, 1] == j)[0]]
            centroids[j, :] = np.mean(pointsInCluster, axis=0)
    return centroids,clusterAssment

def showCluster(dataSet, k, centroids, clusterAssment):
    '''
    可视化
    '''
    numSamples, dim = dataSet.shape
    if dim != 2:
        print "Sorry! I can not draw because the dimension of your data is not 2!"
        return 1
    mark = ['or', 'ob', 'og', 'ok', '^r', '+r', 'sr', 'dr', '<r', 'pr']
    if k > len(mark):
        print "Sorry! Your k is too large! please contact Zouxy"
        return 1
    for i in xrange(numSamples):
        #不同的组显示不同的颜色("o"表示形状为圆形,后面表示不同的颜色)
        markIndex = int(clusterAssment[i, 1])
        plt.plot(dataSet[i, 0], dataSet[i, 1], mark[markIndex])
    mark = ['Dr', 'Db', 'Dg', 'Dk', '^b', '+b', 'sb', 'db', '<b', 'pb']
    for i in range(k):
        # 标识出质心("D"表示形状为菱形,后面表示不同的颜色)
        plt.plot(centroids[i, 0], centroids[i, 1], mark[i], markersize=12)

    plt.show()

if __name__ == "__main__":
    '''
    需求是给一个数据集,根据各个元素之间的关系把具有相似属性的元素归为一类,就是把数据集根据不同的分类要求分成不同的类。
    '''
    dataSet = []
    f = open("数据集在很多博客里面可以找到,在此就不贴出了",'r')
    for line in f.readlines():
        lineArr = line.strip().split(' ')
        dataSet.append([float(lineArr[0]), float(lineArr[1])])
    dataSet = np.array(dataSet)
    k = 4
    centroids, clusterAssment = kmeans(dataSet, k)
    showCluster(dataSet, k, centroids, clusterAssment)

结果展示

看起来还不错

jieguo

算法评估

  1. 在 K-means 算法中 K 是事先给定的,这个 K 值的选定是非常难以估计的。很多时候,事先并不知道给定的数据集应该分成多少个类别才最合适。这也是 K-means 算法的一个不足。有的算法是通过类的自动合并和分裂,得到较为合理的类型数目 K,例如 ISODATA 算法。关于 K-means 算法中聚类数目K 值的确定在文献中,是根据方差分析理论,应用混合 F统计量来确定最佳分类数,并应用了模糊划分熵来验证最佳分类数的正确性。在文献中,使用了一种结合全协方差矩阵的 RPCL 算法,并逐步删除那些只包含少量训练数据的类。而文献中使用的是一种称为次胜者受罚的竞争学习规则,来自动决定类的适当数目。它的思想是:对每个输入而言,不仅竞争获胜单元的权值被修正以适应输入值,而且对次胜单元采用惩罚的方法使之远离输入值。
  2. 在 K-means 算法中,首先需要根据初始聚类中心来确定一个初始划分,然后对初始划分进行优化。这个初始聚类中心的选择对聚类结果有较大的影响,一旦初始值选择的不好,可能无法得到有效的聚类结果,这也成为 K-means算法的一个主要问题。对于该问题的解决,许多算法采用遗传算法(GA),例如文献 中采用遗传算法(GA)进行初始化,以内部聚类准则作为评价指标。
  3. 从 K-means 算法框架可以看出,该算法需要不断地进行样本分类调整,不断地计算调整后的新的聚类中心,因此当数据量非常大时,算法的时间开销是非常大的。所以需要对算法的时间复杂度进行分析、改进,提高算法应用范围。在文献中从该算法的时间复杂度进行分析考虑,通过一定的相似性准则来去掉聚类中心的侯选集。而在文献中,使用的 K-means 算法是对样本数据进行聚类,无论是初始点的选择还是一次迭代完成时对数据的调整,都是建立在随机选取的样本数据的基础之上,这样可以提高算法的收敛速度。

应用场景

分析一个公司的客户分类,这样可以对不同的客户使用不同的商业策略,或是电子商务中分析商品相似度,归类商品,从而可以使用一些不同的销售策略,等等。

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 203,271评论 5 476
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 85,275评论 2 380
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 150,151评论 0 336
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,550评论 1 273
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,553评论 5 365
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,559评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,924评论 3 395
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,580评论 0 257
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,826评论 1 297
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,578评论 2 320
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,661评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,363评论 4 318
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,940评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,926评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,156评论 1 259
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,872评论 2 349
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,391评论 2 342

推荐阅读更多精彩内容