CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(6)正式转染+单克隆细胞筛选

前期记录

先确定目标基因
CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(1)
然后对目的基因进行背景调查
CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(2)磨刀不误砍柴工
设计sgRNA及引物
CRISPR-Cas9(三)--sgRNA设计好之后
CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(3)sgRNA及引物设计
CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(4)构建sgRNA+Cas9载体
转染验证
CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(5)293FT细胞转染验证 and trouble shooting

事实上,在转染验证结束后,对于癌细胞等易转染细胞系,基本上可以立刻进行转染,如果载体带有荧光,则根据荧光筛选阳性细胞,若载体为抗生素抗性,而经过抗生素筛选后可直接进行下一步单克隆细胞筛选。对于难以转染的细胞系,可使用电转或者特殊的转染试剂,再根据荧光或者抗性筛选。
将细胞消化过筛后种96孔板,每孔种一个细胞,前提是要有活细胞工作站,可以定时拍照1星期以上,从而确定单细胞克隆,如果没有这样的仪器,网络上还有其他筛选单细胞的教程,比如稀释法等等(我觉得直接种1孔1个细胞就OK,种完就找到得力的显微镜全孔拍摄)。总而言之,筛选单细胞这一步依赖于实验室平台的条件。
我已经在前两周完成了转染+荧光筛选+扩增冻存一部分,目前种板准备筛选单细胞克隆。由于我养的细胞属于非常难转的细胞系,使用了特殊的转染试剂,转染过后细胞不耐受,荧光筛选之后更加脆弱,实验周期相应拉长。注意,最迟最迟在确认转染成功后开始订购所需的验证性抗体。实验并非一个人可以完成,这和实验室的管理,补给,运营还有实验室成员的帮助有很大的关系,每一个微小的步骤都有可能把人卡得生不如死,希望能顺顺利利,感恩。

2019/09/03

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