公司的实力果然强大的要死，蕾普利上尉在上一部已经带着肚中的异形胎儿跳进火海中死去，公司的教授们根据蕾普利的血然后克隆出蕾普利和异形，若干个样品都失败了，唯独8号产品成功，而且是非常成功。8号复制出来的蕾普利简直像本人复活，只是语言功能很差，还需要不断学习，培植出来的异形是能力强大的异形之母。
在公司的这艘飞船上，军方接管这一切，公司利用无辜的个人做异形的宿主，培养出12个异形，还有异形之母。教授认为蕾普利8号是个副产品，没杀，先留着。贝蒂号飞船上一行人来到这个星球上，军方和公司是想要让这些人做异形的宿主，其中有个年轻女人考尔，她此行就是来消灭蕾普利和异形的。很快，教授就养虎为患，异形都聚集在一起，聪明的异形利用自己的血液腐蚀飞船，一下子便逃了出来，开始斩杀医生和军人。贝蒂号上的雇佣兵们和异形展开激烈的战斗。
异形是无处不在，可是在蕾普利的带领下，屠异形的队伍战斗力极强，他们杀死一个又一个异形。考尔此时和蕾普利站在一起，原来考尔是机器人，子弹打穿了身体也没死，就和当年的主教一样。蕾普利的基因比之前还要更强大，这使得她和异形作战过程中更是厉害，本来就很厉害。将军被异形杀死，教授也不例外，在铁血女战士蕾普利的带领下，众人化险为夷，逃出生天，毁灭了异形。
