今天开始接触R语言数据结构,不过还是需要后期进一步学习才能充分掌握
快速上手常用小命令
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?read.table
当函数或者命令不会用时,可在Rstudio中用这个命令查看帮助,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。
向量及相关操作
定义
向量:多个元素(数字或者字符串)组成的变量。
tips: R语言中的表格被称为数据框
联想到上节课中的“赋值”操作,有时候也需要将向量或一串字符或数据框进行赋值
比如如下代码
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x<- rep(1:3,times=2) #1~3 重复2次从向量中提取元素
多种方式:
1)根据元素位置,例如
x[3] #x第3个元素
x[-3] #排除法,除了第3个元素之外剩余的元素
x[5:8] #第5到8个元素
x[-(5:8)] #除了第5-8个元素
x[c(2,3)] #第2个和第3个元素
2)根据具体的值
例如如下代码
x[x==10] #等于10的元素
x[x<4]
x[x %in% c(1,4,6)] #存在于向量c(1,4,6)中的元素
数据框 (敲重点,数据框很重要)
数据框即为表格
若要读取数据框,需要将其放在正在进行操作的工作目录下,例如
其中 huahua.txt 和 doudou.txt 均为要进行操作的数据框,必须在joyce R project 的目录下。
1)读取本地数据
将该数据框读取后赋值给 a,结果如下
2)设置行名和列名
读取数据框
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt ,变量X赋值为数据框
记住如下两个命令
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
进阶版:更改行、列名称
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x
赋值:X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
就被改为了
如果要撤销,重新用read.table赋值即可
3) 导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) #分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号,单引号和双引号的区别是??)
4)变量的保存与重新加载
以下命令用于保存和重新加载的操作
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData") #保存其中一个变量
load("test.RData") #再次使用RData时的加载命令
保存后如下
5)提取元素
简而言之,想要少,就在[]里写啥
X[x,y] #提取第x行第y列
X[x,] #第x行 注意逗号
X[,y]#第y列
X[y] #也是第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名 #也可以提取列(优秀写法,支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
示例如下
存脚本
将编写的程序save as, 下次可直接调用。
如图,下次用Rstudio打开即可继续使用。
练习:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?
错把x当X,写命令时注意在R中区分大小写