week2-蛋白质与蛋白质的结构、酶及其他、糖酵解

https://www.zybuluo.com/Agathe-Zhu/note/148841
【1】关于极性氨基酸的分类,可以理解为COO带负电而NH3带正点

本周的作业稍难,形式多样很有趣,但是会做错有没有-O-。。。当然每道题下面有discussion会提供一些思路,Whisper_of_the_Wind亲开了个讨论贴http://mooc.guokr.com/post/606529/ ,在遵守Honor Code的前提下可以互帮互助。
总结一下本周内容:
Lecture 3是蛋白质的结构,生物大分子那些不甚有趣。就是要备个小条记好20种氨基酸的极性啊,电荷啊,疏水性啊,那几个special的也是在hydrophobic里的。说实话,以前学生化的时候对这些键啊,特性啊,没有觉得什么重要,但是这门课里还是比较强调的。。。。。蛋白质结构展示包括1)全原子模式(展示1级结构基础),2)卡通模式(展示2级结构基础), 3)棍棒模式(可突出部分结构,观察基团间作用),三维的示例还是比较得我心的,平面的化学式完败。。Lab Video里面那个X线测结构的可以结合着看,知道这些三维来源的实际基础。。。蛋白结构part的重点是,Foldit大家玩了没有,俺卡在4.3关了,过不去啊。。。求抱大腿,可以交流经验。。
Lecture 4 就开始讲酶了,让自己设想一个模通道的开场很touching。。。之后,噔噔噔噔,传说中的save the day的TIM出场了,这个梗到Lecure 5的最后才完满,放长线钓大鱼的节奏啊,教授。。。之前一个师姐做的TIM3,这番才知道,哎呦,是个把G3P转成DHAP的酶偶,在病态增高说明能量转换强劲的节奏?。。。
关于酶的作用机制,Lander讲得很通俗易懂,我回翻了一下以前的教材,一句“降低反应活化能”抽象了一切啊,果然还是视觉系的讲一下TIM的具体过程比较nice。。。做题发现,Oh,只有俩个氨基酸跟底物结合啊的直观比“活化中心”的抽象概念触动大很多。。。不知道大家的生物化学是怎么教的,反正我学的很抽象,唉,各种背背佳。。。那个病毒跟人“合体”的视屏有没有牛人有啊,想看全部唉。。充分利用了溶酶体的弱点达到自己的目的是以前就知道的,但是没有想过具体过程是那么的精巧,纤细。。。众virus“合体”的感觉,越老越丰富的被转染的细胞体系,阿门。。。
Lecture 5呼应之前的fermentation,先从糖酵解开刀,TIM的梗也在算ATP时得以终结。。。狂爱整个pathway的图,一定要贴的

连接糖代谢和氨基酸代谢的强图,直接把我打翻在地啊,亲,为什么没有早遇见你。。。。。
在讲蛋白质2级结构的时候,提到Linus Pauling,Wiki一下,也是个强人啊。。。膜拜膜拜。。。。流水帐一下,安慰做题后的心情。。。

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