Mrbayes install on linux
- 安装brew
- brew 的官方文稿说的是直接到github 上下载install.sh来安装,但是由于众所周知的原因,我们在访问github的时候经常下载失败,所以我把github上的brew install 仓库克隆到了我的gitee仓库,安装可以快很多
git clone https://gitee.com/Shaolin_Xu/brew_install
- 然后执行以下代码:
sh <PATH_to_brew_install>/install.sh brew install openmpi
- 下载mrbayes源代码
- 安装Mrbayes
- 下载完成后,进入mrbayes路径
- 我们前面安装的openmpi是为了可以多核并行,因此我们在configure的时候可以加上一个option
--with-mpi-yes
- 安装:
./configure --with-mpi=yes make sudo make install ##这一步需要root权限
- 使用mrbayes
mpirun -np 核心数目 mb