2019-11-16更新apt源和conda源加快安装

电信的网速使用apt-get都会ping不上,索性更改国内源

打开apt的文件夹

```shell

cd /etc/apt

```

编辑源

vim ./sources.list

点击i进入编辑模式,逐条更新,包括网址后面的命令。

# See http://help.ubuntu.com/community/UpgradeNotes for how to upgrade to                                                                                                       

# newer versions of the distribution.                                                                                                                                           

deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty main restricted universe multiverse                                                                                                 

# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic main restricted                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ## Major bug fix updates produced after the final release of the                                                                                                               

## distribution.                                                                                                                                                                 

deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty-security main restricted universe multiverse                                                                                       

# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic-updates main restricted                                                                                                                                                                                                                                                                                          ## N.B. software from this repository is ENTIRELY UNSUPPORTED by the Ubuntu                                                                                                     

## team. Also, please note that software in universe WILL NOT receive any                                                                                                       

## review or updates from the Ubuntu security team.                                                                                                                             

deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty-updates main restricted universe multiverse                                                                                       

# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic universe                                                                                                                     

deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty-proposed main restricted universe multiverse                                                                                       

# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic-updates universe                                                                                                                                                                                                                                                                                                ## N.B. software from this repository is ENTIRELY UNSUPPORTED by the Ubuntu                                                                                                     

## team, and may not be under a free licence. Please satisfy yourself as to                                                                                                     

## your rights to use the software. Also, please note that software in                                                                                                         

## multiverse WILL NOT receive any review or updates from the Ubuntu                                                                                                             

## security team.                                                                                                                                                               

deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty-backports main restricted universe multiverse                                                                                       

# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic multiverse                                                                                                                   

deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty main restricted universe multiverse                                                                                           

# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic-updates multiverse                                                                                                                                                                                                                                                                                              ## N.B. software from this repository may not have been tested as                                                                                                               

## extensively as that contained in the main release, although it includes                                                                                                       

## newer versions of some applications which may provide useful features.                                                                                                       

## Also, please note that software in backports WILL NOT receive any review                                                                                                     

## or updates from the Ubuntu security team.                                                                                                                                     

deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty-security main restricted universe multiverse                                                                                   

# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse                                                                                                                                                                                                                                                                    ## Uncomment the following two lines to add software from Canonical's                                                                                                           

## 'partner' repository.                                                                                                                                                         

## This software is not part of Ubuntu, but is offered by Canonical and the                                                                                                     

## respective vendors as a service to Ubuntu users.                                                                                                                             

# deb http://archive.canonical.com/ubuntu bionic partner                                                                                                                       

# deb-src http://archive.canonical.com/ubuntu bionic partner                                                                                                                                                                                                                                                                                                        deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty-updates main restricted universe multiverse                                                                                   

# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu/ bionic-security main restricted                                                                                                     

deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty-proposed main restricted universe multiverse                                                                                   

# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu/ bionic-security universe                                                                                                           

deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ trusty-backports main restricted universe multiverse                                                                                 

# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu/ bionic-security multiverse 

安装conda,更新conda源为清华镜像

43  bash Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh -b -f -p ~/conda                                                                                                                   

  44  echo 'export PATH="/anaconda3/bin:$PATH"'>>/.bashrc                                                                                                                         

45  sudo echo 'export PATH="/anaconda3/bin:$PATH"'>>/.bashrc                                                                                                                   

46  echo 'export PATH="~/anaconda3/bin:$PATH"'>>~/.bashrc                                                                                                                       

47  source ~/.bashrc                                                                                                                                                             

48  conda deactivate                                                                                                                                                           

49  conda config --add channels conda-forge # Lowest priorit                                                                                                                   

50  conda config --add channels r # Optional                                                                                                                                   

51  conda config --add channels defaults                                                                                                                                       

52  conda config --add channels bioconda                                                                                                                                       

53  conda config --add channels                                                                                                                                                 

54  conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/                                                                                   

55  conda config --set show_channel_urls yes                                                                                                                                   

56  conda create -y -n transcriptome r-base=3.4.3 python=2.7                                                                                                                   

57  conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/                                                                                     

58  conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/                                                                               

59  conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/                                                                                       

60  conda config --set show_channel_urls yes

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