Nanopore测序技术是最近几年火起来的技术,网上的学习资料不多,主要还是以看文章为主。
在这里我希望能与大家一同学习,共同进步!!
三代测序目前发展的如火如荼, 相关的文章不断涌现。三代测序主要分为两大派别:pacbio的smart sequencing 以及 nanopore公司的nanopore sequencing。今天我简单介绍一下nanopore测序技术。
nanopore公司官网
https://nanoporetech.com/
1. nanopore sequencing原理
相比于文字,视频更加生动形象。这里我想大家推荐『陈巍学基因』系列的第59个视频『nanopore sequencing』。
陈巍来自于药明康德基因组学中心,『陈巍学基因』系列介绍了很多生物医学的最新技术进展,非常值得一看。各大视频网站都能找到这个系列,也可以直接到他的微博『陈巍学基因』去找。
2. nanopore sequencing发展历史
这一部分我主要参考2016年发表在『Nature Biotechnology』上的一篇文章:Three decades of nanopore sequencing。
上面的时间轴是2016年之前,nanopore测序发展史上的重要事件。
近两年,nanopore领域发生的大事也很多,例如今年一月发表在『Nature Biotechnology』上的文章:Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads
上图是1989记载了nanopore灵感的笔记本
3. nanopore产品
4. nanopore应用
研究领域:
潜在应用
发表文章:
可以直接在pubmed上搜"nanopore sequencing",也可以在nanopore官网的publications一栏中找
nanopore官网: https://nanoporetech.com/publications
pubmed: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=nanopore+sequencing
从文章最开始的视频中,我们会发现nanopore测序技术与二代测序技术差异很大,这也导致后续的分析与二代测序有很大的差异,相关内容我下一篇文章再讲。
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