写在前面
从某个角度上来说,「TBtools」基本长成一个相对常见的,偏向于大众化的生物信息学小工具。过去几年的不间断开发,不仅仅得到用户认可,也得到了部分生信科研工作者的认可。其间,浙江大学陈铭老师有联系到我们,讨论是否在他主编的「生物信息学」书籍中,增加「TBtools」章节。当然,我们很乐意,于是有了如下。
《Integrative Bioinformatics》简介
书籍的第一版在2014年出版,那会我们不知道生物信息存在。这一版本,即书籍的第二版。全书分为 5 个部分:
- 介绍了生信发展历史,同时兼顾植物生物信息相关发展
- 概览了生物信息在线数据资源,如网络数据库以及相关工具
- 重点关注多组学整合分析技术,其开发与应用
- 详细讲述了生物分子调控网络分析策略与实现
- 展现了系列数据驱动型生物信息学工具与平台
「TBtools」相关部分在第 5 部分,第 17 章。
第 17 章「TBtools」 讲了啥?
we describe the design philosophy, development objectives, and main characteristics of TBtools.
We also provide a comprehensive introduction of its main functions, especially
those included in the “Sequence Toolkits” and “Graphics” catalogs, and advanced
features, like R plugins that contributed by senior users. A few practical tutorials
are presented to demonstrate the superb functionalities and outstanding interactive
nature of TBtools.
相比于期刊文稿,书籍编写会更自由一些,我们可以尽情写一些觉得值得一写的。
- 设计理念与开发目标,
- 「TBtools」功能概览(含最新特性 - 至2021年)
- 使用示例
感兴趣可直接查看原始书籍。
《Interactive Data Analyses Using TBtools》
https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-981-16-6795-4_17
为什么说是「第二次」
早前,老孟与我讨论,提了下他要搞本书。也忘了大体是啥时候,反正就是很久,后来就没有后来了。于是今次的这本属于「第二次」参与,但却是第一本。
写在最后
近期事情比较多,就简单介绍一下。事实上,这个事情也至少是一个月以前的事情。好,感兴趣的朋友看看书籍原文。