我之前在博客园写过一篇文章,是介绍生物学中基因组分析的plink的基本用法的,但是感觉博客园里有很多限制,不如在简书上写的畅快,所以打算把上面的东西迁移过来(不过由于我的文件在拷贝过程种,大量的文件误删,致使样本文件丢失,实在令人心痛,不过,本篇文章即使没有样本也可以学习使用)。
全基因组关联分析是利用统计方法研究与性状相关联的基因。常用的软件有plink,tassel,falmm等,
其中尽管R语言中提供了几种常见的文件格式,个人感觉plink文件格式已经成为了广泛使用的基本格式。下面
是我在学习期间的plink学习总结,请笑纳: