我们有时需要下载GEO数据,使用getGEO的话比较麻烦,特别是当我们只需要其中某一两个文件时。但是当我们直接复制文件链接,使用wget下载时,却只能下载当前的网页。
经过我的摸索,终于找到了可以使用wget下载GEO数据的方法。
首先在GEO数据库中找到你需要下载的数据
右键复制链接地址
打开链接在线转换,进行链接转化
复制真实地址,在新标签页打开
再右键复制所需文件的链接
这时就可以使用wget进行下载了
wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/samples/GSM3930nnn/GSM3930268/suppl/GSM3930268_FHC-2_hic_allValidPairs.txt.gz