各物种转录组数据下载和可视化

一、🌽 玉米:

  1. ZEAMAP,需要注册才能下载tsv数据。
    Zeamap Tissue Expression.png
  1. ePlant_maize,但需要进行id转换,如GRMZM2G158252。
    eFP_maize.png
  1. maizegdb的qTeller,可下载svg格式的图片,非常方便!
    qTeller.png

二、🌾水稻:

rap-db 下载,如转录本Os11t0559200-00,搜索,可以找到

https://rapdb.dna.affrc.go.jp/viewer/gene_detail/irgsp1?name=Os11t0559200-00;feature_id=358318

水稻转录本.png

四、小麦:

  1. http://202.194.139.32/,可以下载svg格式图片,且支持下载原始数据或转化后的数据!
    WheatOmics 1.0 转录本数据.png
  1. http://bar.utoronto.ca/eplant_wheat/,注意是老版本id号!该网站支持基因表达可视化,非常形象、通俗易懂!

  2. Wheat Expression Browser,非常推荐到该网站上下载图片和数据。

    小麦转录本.png

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