Hisat2 安装

hisat2的安装

1.下载

wget  ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-source.zip

运行结果

2.解压

unzip hisat2-2.1.0-source.zip

结果

一般源代码安装需编译后再安装，编译前需要检查配置，即执行./configure命令来完成，但hisat2不需要执行./configure ，直接编译安装即可
3.安装

make

结果

编译安装需要一定时间，耐心等待即可，需要注意的是在编译安装前需要保证已经安装了g++编译器，不然是无法编译安装的，可以查看一下是否安装了g++
4.安装完成

hiast2 -h

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