昨天得知说三四月就要开题了。。。我还什么都没做呢！！！
急 很急 我是急急国王
昨天在NCBI把近缘物种的基因组数据下下来了，在我硬盘里，我现在有点不明白的就是为啥有时候会空包，有的是tar 有的是zip。
开花的基因家族也找出来了，MADS家族的起名原因是他们有一个共同的结构域。比较有名的就是AP1，目前蝴蝶兰花的时空组好像也做出来了，不知道能不能参考一下。但是我的花是对生，花苞片非常明显，有一个退化的雄蕊（姜科的共同特征），可以参考一下他们选的marker基因
现在有问题就是，我想画共线性的图是不是需要分出我物种的染色体，交接的老师说做过了，但是我没找到哪个文件。问师弟说gff文件都是自带染色体的，我没看出来我这哪里有
上午安装了wgdi 能用，但是把别的文件夹的gff文件fasta文件软链接过来费了半天的劲。最后也没做出什么东西，好像是NCBI下载的gff文件是要预处理一下
我在想第一步就做共线性分析是不是有点早，感觉在这步之前还要画个树，分析一下分歧时间？再分析一下WGD？而且我一直都很想画一个圈图。就是那种GC含量，甲基化含量，重复序列含量啥的，按照染色体一圈的那种。
昨天下载的基因组数据我感觉是都下完了，但是没有去Phytozome (doe.gov)和esemble去找。拟南芥作为模式物种是不是应该也要下载一下？我个人不是很习惯用linux命令，目前一些基本操作还是在windows上进行，效率不高只能说
复盘：思维太跳跃了，有时候手头的事没做完就去做另一个，导致最后啥都没做成。明天周四要做一个汇报的ppt出来，然后跟老师说个正月十五快乐吧。。。
