Conda是什么
- Linux的应用商店
- 最方便快捷的软件下载器
- 90%以上的软件都能搜到,一键安装
- 日常生信使用小而精的Miniconda即可
安装Conda(省略)
Conda操作
-
conda list
:查看当前服务器上安装的所有软件列表 -
conda search 软件名
:搜索conda软件 -
conda install 软件名 -y
:安装软件(-y是指安装过程中的问题都回答yes) -
conda install 软件名=版本号 -y
:安装特定版本软件 -
conda remove 软件名 -y
:卸载软件 -
conda update 软件名
:conda update 软件名 -
conda info --envs
:查看当前conda有什么环境 -
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
:建立rna-seq环境,指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic -
conda activate rna-seq
:激活conda环境 -
conda deactivate
:退出当前环境 -
conda卸载:
第一步——rm -rf ~/miniconda3
第二步——环境变量中去掉conda,vi ~/bash_profile
删除conda路径,退出保存