安装和加载R包
1.镜像设置
R的配置文件 .Rprofile
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
2. 安装
3.加载
一般都是用library(包)
require(包)
dplyr五个基础函数
1.mutate(),新增列
mutate(矩阵名, 新增列名 = 值)
例:mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)
2.select(),按列筛选
例:select(矩阵名,列数)
select(矩阵名, 列名)
3.filter()筛选行
filter(矩阵名, 列名 == "值")
filter(矩阵名, 列名 %in% c( "值1", "值2", "值3"))
4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序
arrange(矩阵名, 列名)#默认从小到大排序
arrange(矩阵名, desc(列名))#用desc从大到小
5.summarise():汇总
summarise(矩阵名, mean(列名), sd(列名))# 计算某列的平均值和标准差
group_by(矩阵名, 列名) # 先按照矩阵名分组,计算每组矩阵名的平均值和标准差
例summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
dplyr两个实用技能
1、管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
2:count统计某列的unique值
count(矩阵名,列名)
dplyr处理关系数据:对2个表进行连接,注意:不要引入factor
1.內连inner_join,取交集
inner_join(表1,表2, by = "列名")
2.左连left_join
left_join(表1, 表2, by = '列名'), 新的表行数=左边的表1,新列值来自于右边表2,没有的值na
3.全连full_join
full_join( test1, test2, by = 'x')
4.半连接
semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')
返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
5.反连接
anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')
返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
6.简单合并
相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数
bind_rows()函数需要两个表格列数相同,合并行需要有相同列数
bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数,合并列需要有相同行数
思维导图