医学文献结构化泛读方法
【结构化阅读】快速提取关键信息
文献阅读难点
专业英语：日常基本用不到专业英语词汇
实验方法：眼花缭乱的各种实验名称
Biomarkers：是明星但你很陌生的分子名称
阅读成长三阶
阅读成长三阶
医学文献分类
临床研究：病例报告、病例对照、队列研究、横断面研究、 RCT 研究
基础研究：
干研究
干湿结合
-
湿研究（分子、细胞、动物实验内容）
生信挖掘+简单表型
样本检测+统计分析
细胞表型+分子机制
动物模型+指标检测
题目四要素
科学假设：在【疾病】中，【分子】经由【机制】介导了【表型】
五恒量三变量
单变量论证
分子→（需证明）表型→（已知）疾病
药物→表型（药效）→疾病
表达差异、正反回复、细胞动物
二元变量论证
二元变量论证
逻辑论证主次
| 单变量论证 | 主变量论证 | 因变量论证 | |
|---|---|---|---|
| 表达差异 | ✔️ | ✔️ | ①A 调节表型（单变量论证） |
| 正反回复 | ✔️ | ✔️ | |
| 细胞动物 | ✔️ | ✔️ | |
| 调控关系 | ✔️ | ✔️②A 调节 B（二元变量论证） | |
| 回复验证 | ☑️ | ☑️③A 调节表型依赖 B（回复） |
回复实验策略
image
| 分子（主变量） | 通路（因变量） | 表型 | ||
|---|---|---|---|---|
| ↑过表达 | ↑☒阻断- | 观察表型 | 假设分子与通路间是正向调控 | 正正反 |
| ↓沉默 | ↓☒激活+ | 观察表型 | 正反正 | |
| ↑过表达 | ↓☒激活+ | 观察表型 | 假设分子与通路间是负向调控 | 反正正 |
| ↓沉默 | ↑☒阻断- | 观察表型 | 反反反 |
三元变量论证
三元变量论证
间接还是直接
间接还是直接
-
转录因子：蛋白调节下游基因的启动子 DNA，从而影响基因转录过程
- 适用于下游为功能蛋白或 ncRNAs
-
miRNA： miRNAI 调节下游基因 mRNA 的 3-UTR，从而影响基因转录后过程
- 适用于下游为功能蛋白
-
编码基因：蛋白可以调节靶基因的 DNA、转录、转录后、翻译、翻译后全部五个水平
- 主要研究蛋白-蛋白相互作用
-
lncRNA：lncRNA 可调节靶基因的 DNA、转录、转录后、翻译、翻译后全部五个水平
- 主要研究 RNA-RNA 和 RNA-蛋白相互作用
逻辑九宫格
逻辑九宫格
数据表现四维
数据表现四维
小结
1题目四要素
疾病、表型、分子、机制
2五恒量三变量
恒量：疾、型、模、法、标
变量：药物、分子、通路
3单变量论证
表达差异、正反回复、细胞动物
4二元变量论证
A 调节表型、A 调节 B、A 调节表型依赖于 B
5Rescue策略
正正反、正反正、反正正、反反反
6间接直接机制
蛋白-DNA、蛋白-蛋白、RNA-RNA、RNA-蛋白
7数据表现四维
组织水平、细胞水平、动物水平、分子水平
