Linux系统下生信软件的安装
step1.1 查看自己系统的版本
step1.2 搜索与系统对应的Miniconda3版本
step1.3 下载Miniconda3
wget -c 断点续传
step2.1 bash安装Miniconda3
step2.2 source激活Miniconda3
step2.3 添加镜像
一行一行粘贴进去吧
# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
step2.4 查看当前软件列表
step2.4 搜索软件
step3.1 安装软件
-y自动安装
step3.2 检查是否安装成功
step4.1
扩展:当你要进行多个组学流程分析的时候,如果有软件冲突,可以参考下列办法
step4.2 创建另一个环境变量
step4.3 激活环境变量
卸载软件
conda remove fastqc -y
好了,现在已经成功安装了软件,当软件出了故障无法解决时,建议直接删除Miniconda3
rm -r miniconda3/