首先简述一下影片的故事情节：一位名叫柯尔特·史蒂文的上尉，某日当他醒来时发现自己正在一辆前往芝加哥的火车上，而他在火车的主要目的就是要找到是谁把炸弹放在了火车上。就是这样过程，却被重复的“播放”（因为这是Source Code世界）。Source Code世界是由博士制造的，根据人在死后，大脑的电磁场仍然带着电，并没有完全死去，还能够运转，但是只有短暂的8分钟之久。换句话说，当柯尔特·史蒂文回到已经发生过爆炸的列车上时（是通过仪器把他传送到过去），他只有8分钟时间可以用。在8分钟之内无论他是否找到凶手，他都会死去（但是最后他打破了这个定论）。
可能你会疑问，是柯尔特·史蒂文的身体和脑电波一起回到列车上还是仅仅他的脑电波被附在了列车上的某个人身上？答案是他的脑电波附在了列车上的肖恩芬特雷斯教师的大脑里。肖恩芬特雷斯是发生爆炸的列车上的一名乘客，并和克莉丝汀有渊源（肖恩芬特雷斯和克莉丝汀在爆炸中都死了）。
为什么影片开头柯尔特·史蒂文一脸迷茫？车上的人认识他，他对一切却感觉到陌生？因为当时的“柯尔特·史蒂文”并不是真正的他自己，而是柯尔特·史蒂文的脑电波和肖恩芬特雷斯躯体的结合体（暂时称为柯尔特肖恩）。真正的柯尔特·史蒂文其实是在实验室里，靠仪器存活。因为他在一次飞行任务中只剩下了一个大脑和半个躯体，并且一直处于昏迷，所有的对话都是他的脑电波在和女军官古德温进行。在女军官古德温的帮助下，柯尔特·史蒂文一次又一次的回到列车上寻找凶手，并且喜欢上了克莉丝汀。在倒数第二次进入列车上时，“结合体”柯尔特肖恩找到了放炸弹的凶手——德瑞克弗罗斯特，但是他和克莉丝汀都被凶手杀害了，接着柯尔特·史蒂文又回到了现实中，在大家努力下抓到了又将进行第二次作案的凶手，也就是列车上的德瑞克弗罗斯特。
也许会有疑问，1：现实世界和Source Code世界有什么关系？2：在Source Code世界发生的事情会不会影响到现实世界？3：结局又是什么意思？
1：现实世界和Source Code世界是两个完全平行的世界，Source Code不是时空之旅，而是关于时间的重新分配，让我们能够进入平行的现实，在8分钟之后没有未来
2：既然现实和Source Code是平行的，所以就不存在相互牵连的情况，就好像两条平行线，永远不可能相交，但是在Source Code看到的信息是能够用在现实世界的，是不失真的。比如在Source Code里看到凶手的车牌号，告诉现实世界最后抓到凶手。
3：结局可以说这个电影最难懂的部分，也可以说很意味深长，很多人说是画蛇添足，其实不是的。大家肯定记得柯尔特·史蒂文在执行完任务后对女军官古德温说，还要再次进入Source Code，去救克莉丝汀，并要求8分钟后结束现实世界里的昏迷不醒的柯尔特·史蒂文的生命。女军官古德温并不相信他能够改变Source Code的一切，因为她认为8分钟后就没有任何意义了（大家要记住此时的古德温是现实世界的古德温）。但是出于对柯尔特·史蒂文的同情她还是同意了他的要求，将他送进了Source Code。记住，此时是在Source Code，这也是柯尔特·史蒂文最后一次进入Source Code，结合体柯尔特肖恩惩治了恐怖分子德瑞克弗罗斯特，并刚好在第8分钟kiss了克莉丝汀，而此时现实世界的女军官古德温也刚好结束了柯尔特·史蒂文生命。但是奇迹出现了，Source Code里的柯尔特肖恩并没有死，这是为什么呢？首先来说，电影里解释说两个世界是平行的，所以现实世界女军官古德温关掉仪器开关造成柯尔特·史蒂文死亡并不能影响Source Code里的结合体柯尔特肖恩，反而在某种程度上来讲刚好促成了Source Code里的结合体柯尔特肖恩可以不死；其次也许这就是爱的力量（电影里常常讲的）。
接下来就好解释了，因为镜头接下来发生的所有事情都是在Source Code里面进行的，有些人之所以看不懂结局也许就是因为把下面发生的事还当做是在现实世界。结合体柯尔特肖恩在列车上给女军官古德温发了一条短信（此时已经把恐怖分子烤在了火车上，并且打过电话报警），这个短信是关键。其实阅读短信的那个女军官古德温并不是电影刚开始出现的那个现实世界的女军官古德温，而是Source Code里的军官古德温，她也并不知道是谁给她发的短信，当她面对博士看到手机短信上凶手的名字和别人说的一样的时候，并不知道这一切是怎么回事。她看到躺在仪器箱子里活着的柯尔特·史蒂文也是真正的Source Code里的柯尔特·史蒂文，并不是在现实世界里死去的柯尔特·史蒂文，此时的一切都是发生在与现实世界平行的Source Code世界，而结合体柯尔特肖恩和克莉丝汀也过上了幸福而有美好的生活。
看到这里也许大家想到了《盗梦空间》里一直旋转的陀螺，也许导演也在告诉我们，到底哪个是现实世界，而哪个是Source Code世界
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