【实现】利用罗杰斯特回归预测疝气病马死亡率

利用Logistics Regression罗杰斯特回归预测疝气病马死亡率。

1. 收集数据

收集的数据划分成训练集和测试集,每个样例包括21个特征和1个类别标签。

数据格式

2. 准备数据

要求数据类型为:数值型;另外,结构化数据格式最佳。

用Python解析文本文件并填充缺失值。

缺失值的填充方式:

--使用可用特征的均值来填补;

--使用特殊值来填补,如-1;

--忽略有缺失值的样本;

--使用相似样本的均值填补缺失值;

--使用另外的机器学习算法预测缺失值;

不同的处理方式之间各有优劣,同时,具体问题需要具体分析,没有普适的处理方法。

3. 分析数据

可视化并观察数据。

4. 训练算法

使用优化算法,找到最佳的系数。

数据样本之间服从罗杰斯特分布。分布函数为:

分布函数

函数定义:

def sigmod(x):

    return 1/(1+exp(-x))

Sigmod函数:

优化算法,主要是梯度算法(下降or上升)。

A. 梯度上升算法

设定循环迭代次数,权重系数的每次更新是通过计算所有样本得出来的。当训练集过于庞大时,不利于计算。

alpha:步长,又称为学习率。

def gradAscent(dataMatIn, classLabels):

    dataMat= mat(dataMatIn)

    labelMat= mat(classLabels).transpose()

    m, n= shape(dataMat)

    alpha= 0.001

    maxCycles= 500

    weights= ones((n,1))

    for k in range(maxCycles):

        h= sigmod(dataMat*weights)

        error= (labelMat- h)

        weights= weights+ alpha*dataMat.transpose()*error#省去了数学推导式

    return weights

B. 随机梯度上升

对梯度上升算法进行改进。权重系数的每次更新通过训练集的每个记录计算得到。

可以在新样本到来时对分类器进行增量式更新,因而,随机梯度上升算法是一个在线学习算法。

这种参数更新算法:容易受到噪声点的影响。在大的波动停止后,还有一些小的周期性波动。

def stocGradAscent0(dataMat,classLabels):

    m, n=shape(dataMat)

    alpha= 0.01

    weights= ones(n)

    for i in range(m):

        h= sigmod(sum(dataMat[i]*weights))

        error= classLabels[i] - h

        weights= weights+ alpha*error*dataMat[i]

    return weights

C. 改进的随机梯度上升算法

学习率:变化。随着迭代次数的增多,逐渐变下。

权重系数更新:设定迭代次数,每次更新选择的样例是随机的(不是依次选的)。

def stocGradAscent1(dataMat, classLabels, numIter=150):

    m,n= shape(dataMat)

    weights= ones(n)

    for jin range(numIter):#迭代次数

        dataIndex= range(m)

        for i in range(m):#依据训练集更新权重系数

            alpha= 4/(1.0+j+i) + 0.1

            randIndex= int(random.uniform(0,len(dataIndex)))#确保随机性

            h= sigmod(sum(dataMat[randIndex]*weights)) 

            error= classLabels[randIndex] - h

            weights= weights+ alpha*error*dataMat[randIndex]

            del dataIndex[randIndex]

    return weights

分类算法

def classifyVector(inX, weights):

    prob= sigmod(sum(inX*weights))

    if prob> 0.5:

        return 1.0

    else:

        return 0.0

5. 测试算法

为了量化回归效果,使用错误率作为观察指标。根据错误率决定是否回退到训练阶段,通过改变迭代次数和步骤等参数来得到更好的回归系数。

def colicTest():

    frTrain= open('horseColicTraining.txt')

    frTest= open('horseColicTest.txt')

    trainSet= []; trainLabels= []

    for line in frTrain.readlines():

        line= line.strip().split('\t')

        lineArr= []

        for i in range(21):

            lineArr.append(float(line[i]))

        trainSet.append(lineArr)

        trainLabels.append(float(line[21]))

    trainWeights= stocGradAscent1(array(trainSet),trainLabels)

    errorCnt= 0; numTestVec= 0.0

    for line in frTest.readlines():

        numTestVec+= 1

        currLine= line.strip().split('\t')

        lineArr= []

        for i in range(21):

            lineArr.append(float(currLine[i]))

        if int(classifyVector(array(lineArr),trainWeights)) != int(currLine[21]):

            errorCnt+= 1

    errorRate= float(errorCnt)/numTestVec

    print ("the error rate of this test is: %f" % errorRate)

    return errorRate

通过多次测试,取平均,作为该分类器错误率:

def multiTest():

    numTests= 10; errorSum= 0.0

    for k in range(numTests):

        errorSum+= colicTest()

    print ("after %d iterations the average error rate is: %f" %(numTests,float(errorSum)/numTests))

运行结果:

错误率为36.1%。

6. 小结

优点:计算代价不高,易于理解和实现;

缺点:容易欠拟合,分类进度可能不高;

使用数据类型:数值型和标称型数据。

下一章:准备把罗杰斯特回归设计的梯度上升算法的数学推导,梳理一下并证明。

To Be Continued!

祈年殿
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