数据库
NCBI主站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
拟南芥:https://www.arabidopsis.org/
AmiGO2
STRING
Pham
序列比对、寻找同源蛋白、基因
BLAST:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
获得蛋白氨基酸含量、等电点等参数
ProParam:https://us.expasy.org/tools/protparam.html
蛋白疏水性分析
ProScale:http://expasy.org/cgi-bin/protscale.pl/
蛋白跨膜区分析
TMHMM2.0:http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/
TMPred:http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html
蛋白信号肽分析(预测蛋白在细胞中的位置)
PSORT:http://psort.hgc.jp//
蛋白结构域(motif)分析
Prosite:http://www.expasy.org/prosite/
ProScan:http://www.ebi.ac.uk/InterProScan/
SMART:http://smart.embl-heidelberg.de/#
MEME:http://meme-suite.org/tools/meme
蛋白二级结构预测
SOMPA:http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopma.html
蛋白三级结构预测
SWISS-MODEL:http://swissmodel.expasy.org/