又到了推荐R语言书籍的时候了,此次推荐的书籍部分参考@二货潜 推荐的,链接:R语言书籍
有一部分是我觉得不错的:
1. R语言语法:
[1]. 首推海爷的<R for data science>,这个之前我也推荐过
[2]. 其次是< advanced R> advanced R
[3]. 一些技巧性的书<The Art of R Programming>
[4]. 还有美国辛辛那提大学的R的基础书籍也很棒: 辛辛那提大学的R的基础书籍
[5]. 如果有需要写包的同学,可以在看下海爷的<R Packages by Hadley Wickham>,当然还有一个文档也是介绍R包开发的: https://swsoyee.vercel.app/2021/02/writing-r-packages-a-modern-workflow-for-beginners/
[6]. <Text Mining with R>一本利用R语言进行文本挖掘,拆字符串的Text Mining with R
[7]. 还有@二货潜 推荐的: R查图的R查图大全
[8]. Practical R for Mass Communication and Journalism
链接： 链接：传送门
提取码：91f8
相信大家都有各种渠道下载它们
[9]. 还有个画热图的宝藏工具书：ComplexHeatmap
[10]. 如果对R网页感兴趣的同学不妨看下海爷的《Mastering Shiny》：
Mastering Shiny
[11] circlize
2.统计学与机器学习:
[1]. <R数据科学>比较基础,前线易懂
[2]. <统计学与R读书笔记>这个就更经典了,可以当成一本字典来用
[3]. 还有两本是@二货潜 推荐的,我还没有看过<An Introduction to Statistical and Data Sciences via R> https://moderndive.com/index.html
[4]. Modern Statistics for Modern Biology：Modern Statistics for Modern Biology
[5]. 有关机器学习的: <An Introduction to Statistical Learning with applications in R>
这本比较基础,基于统计的
B站也有对应的视频课：An Introduction to Statistical Learning with applications in R 视频课
[6]. 另外一本比较进阶的书是<The Elements of Statistical Learning>当然,熊已经在博客上将其翻译了The Elements of Statistical Learning
[7]. 最后推荐个网站,关于R 的:
R :传送门
[8]. 分析结构方程与统计的：Structural Equation Modeling in R for Ecology and Evolution
[9].生物医学统计R版：传送门
[10]. R与统计及ggplot画图：传送门
3. 有关NGS的
[1]. 生信:传送门
[2]. 还有欧老师的这本书也不错
欧老师书籍
[3]. 这本也超赞,是关于R与基因组的,里面介绍了相关基因组操作的包:<Computational Genomics with R> Computational Genomics with R
[4]. 如果对单细胞RNA-seq感兴趣的同学，这里还有一本关于R包singleR的书
singleR
以及seurat的官方教程:
seurat官网
[5]. 以及Y叔的ggtree online的书：ggtree
[6]. 四个单细胞教程推荐:
https://scrnaseq-course.cog.sanger.ac.uk/website/index.html
https://broadinstitute.github.io/KrumlovSingleCellWorkshop2020/index.html
NBIS 2021的课程：https://nbisweden.github.io/workshop-scRNAseq/
