Nature|肿瘤代谢物通过干扰染色体信号来抑制DNA修复

导语:2020年06月03日,来自美国耶鲁大学的Parker L. Sulkowski等在Nature上发表了题为“Oncometabolites suppress DNA repair by disrupting local chromatin signalling”的研究文章,该研究揭示了代谢物(2HG、琥珀酸、延胡索酸)干扰DNA修复的通路。肿瘤细胞代谢物通过抑制组蛋白去甲基化酶KDM4B的活性,造成DNA断裂位点的H3K9me3高甲基化,从而影响同源重组修复HDR。随后,HDR关键分子TIP60和 ATM及下游修复因子在DNA断裂位点富集减少。因此,该研究为肿瘤代谢物诱导的HDR抑制提供了分子机理,为肿瘤治疗提供了潜在治疗策略。

Parker L. Sulkowski, et al., Nature (2020)

背景

代谢物紊乱及基因组完整性破坏是肿瘤的标志。人类恶性肿瘤中IDH1或IDH2、FH及SDHA,SDHB,SDHC和SDHD的体细胞突变分别导致肿瘤代谢物2HG、琥珀酸、延胡索酸水平上升。近期有研究表明这些代谢物与DNA修复相关,即这些代谢物抑制HDR通路,并适度增加肿瘤对PARP抑制剂的敏感性。但是,这些代谢物抑制HDR通路的机制仍然不清楚。

肿瘤代谢物2HG、琥珀酸、延胡索酸可以抑制a-KG依赖的双加氧酶,包括组蛋白去甲基化酶KDM4A、KDM4B。

关键科学问题

肿瘤代谢物2HG、琥珀酸、延胡索酸抑制HDR通路的机制是什么?

组蛋白去甲基化酶KDM4A、KDM4B是否参与肿瘤代谢物2HG、琥珀酸、延胡索酸抑制HDR的过程?

结果

Fig 1:肿瘤代谢物直接抑制HDR。

Fig 2:肿瘤代谢物抑制HDR因子向DNA双链断裂位点DSBs的逐步招募过程。

Fig 3:肿瘤代谢物通过抑制KDM4B来抑制HDR。

Fig 4:异常的H3K9甲基化破坏HDR,从机理上揭示了肿瘤代谢物诱导的HDR缺陷。

总结

肿瘤异常水平的代谢物通过“代谢物-KDM4B-H3K9高甲基化-HDR因子招募”的通路,来影响DNA修复,并增加肿瘤对PARP抑制剂的敏感性。

通讯作者

Peter M. Glazer

Peter M. Glazer, MD, PhD

Robert E. Hunter Professor of Therapeutic Radiology and Professor of Genetics;

Chair, Department of Therapeutic Radiology;Yale University School of Medicine。

主要经历:

PhD:Yale University (1987)

MD:Yale University (1987)

MSc:University of Oxford, Biochemistry (1981)

BA:Harvard University, Chemistry (1979)

Resident:Yale-New Haven Hospital

Board Certification:AB of Radiology, Radiation Oncology (1992)

主要研究:

1,Tumor hypoxia, DNA repair, and cancer therapy;

2,Oncometabolites and DNA repair;

3,DNA repair inhibitors for cancer therapy;

4,Tumor specific targeting of microRNAs and other undruggable targets;

5,Gene editing via triple helix formation。

Ranjit S. Bindra

Ranjit S. Bindra, MD, PhD

Associate Professor of Therapeutic Radiology,Yale University School of Medicine。

主要经历:

MD:Yale University School of Medicine (2007)

PhD:Yale University Graduate School (2005)

BS:Yale University (1998)

Resident:Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

Intern:Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

Board Certification:AB of Radiology, Radiation Oncology (2013)

主要研究:

1,Development of novel cell-based assays for high-throughput screening;

2,Development of synthetic lethal targeting strategies。

参考资料

https://medicine.yale.edu/profile/peter_glazer/?tab=research

https://medicine.yale.edu/research-profile/ranjit_bindra/?tab=research

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