The Landscape of Circular RNA in Cancer
1.外显子捕获技术RNA-seq技术优于Ribo-Zero
2.PRAD和BRCA受激素调节影响 与转录因子有极大相关性
3.R shiny 可以开发网站
4.我们可以下载数据对区域做注释
5.宿主基因的表达和circRNA的表达没有直接关系,但两者差异趋势一样
6.借鉴以下图做表达散点图 横纵坐标卡阈值 取大于90%样本
7.circRNA侧翼内含子长度越长,表达越高
8.基因融合circRNA
(1)f-circRNA:跨染色体融合
(2)RT-circRNA:同一染色体相邻基因融合
9.在UCSC上下载重复原件 ----形成circRNA的必要条件
10.circRNA半衰期长 可以作为临床Biomarker
11.外泌体
1983年,外泌体首次于绵羊网织红细胞中被发现,1987年Johnstone将其命名为“exosome”,即外泌体。人体几乎所有类型的细胞都能分泌外泌体,外泌体广泛存在并分布于各种体液中,携带多种蛋白质、mRNA、miRNA和脂质类物质等,作为重要的传递信号分子,形成了一种全新的细胞-细胞间信息传递系统,可参与细胞通讯、细胞迁移、血管新生和肿瘤细胞生长等过程。
作者:南博屹生物医学
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来源:简书
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