1.在Python上用scanpy分析单细胞的时候,做到sc.pp.calculate_qc_metrics(adata, qc_vars=['mt'], percent_top=None, log1p=False, inplace=True)
这一步时报错:
ValueError: Length of values (1) does not match length of index with sc.pp.calculate_qc_metrics(adata)
原因是pandas版本>1.3,导致的不兼容
解决方法:把pandas卸载了,重新安装1.2.5版本
pip uninstall pandas
pip install pandas==1.2.5