前期记录
先确定目标基因
CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(1)
然后对目的基因进行背景调查
CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(2)磨刀不误砍柴工
设计sgRNA及引物
CRISPR-Cas9(三)--sgRNA设计好之后
CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录(3)sgRNA及引物设计
读者补充
上次推文我针对sgRNA设计方面增加了一部分内容,有一位特别棒的读者(简书名:chuxinxzz)在下方给我留言说可以使用Cas9+sgRNA切割效率试剂盒验证切割效率,并且经实践得知,验证结果和实际编辑结果相差无几。感谢他给我的补充,这也是我写下去的动力,毕竟我一个人的精力是有限的,因此不论我好与坏,我都先把自己拎出来,以期待得到其他人的交流和答复,从而学到更多的经验。
昨天和今天
昨天我依照golden gate assembly的方法,参照了张峰老师实验室protocol,使用了BbsI限制性内切酶和T4连接酶,将合成好的sgRNA插入到带有Cas9的质粒中;接着转化到感受态细胞中--复苏感受态细胞后--涂氨苄西林平板过夜培养--今天傍晚挑取单克隆菌落置于氨苄西林+LB培养基中过夜培养,明日即可提取质粒并酶切验证。但由于293FT细胞冻存于液氮罐中,今日打台风没有来得及复苏该细胞,因此转染实验有拖后。
下一步
质粒小提试剂盒
酶切实验使用到的相关限制性内切酶(BbsI)
准备好293FT细胞(应提前准备,一旦酶切验证成功,立即转染筛选),也就是在这一步,可以使用上文提到的读者建议用的酶切效率试剂盒。如此看来,可以节约下至少4-6天的时间,当真是好办法的。
感谢师兄DZ