曾有研究统计，肥厚型心肌病超过50%是由于基因变异引起的。阜外医院近年来统计结果为肥厚型心肌病基因突变检出率在70％左右。肥厚型心肌病最常见的遗传方式是常染色体显性遗传，也就是说，如果患者是由于基因变异引起的肥厚型心肌病，那他的后代有50%的概率携带着这个变异基因，很有可能同样发病。
变异的基因
肥厚型心肌病的基因突变有两个可能途径，一种是父母遗传，另外一种途径是胚胎发育时候自身突变。每个人都存在一些基因突变，大多数是没有意义的，不会导致疾病，但是一部分人的基因突变是致病的。肥厚型心肌病基因发生突变就可能引起疾病。父母正常，孩子发现新的基因突变，这在阜外医院前期的患者中也存在。比如怀孕时候接受射线，化学制剂，生物制剂等等都有可能加大基因突变的概率。但人类自身在自然胚胎发育过程就可能出现基因突变。
带着变异基因的人，可能一辈子不发病；也可能在一定年龄才表现肥厚型心肌病症状，或并出现心肌肥厚；也有刚出生就表现心肌肥厚；更有些人刚开始表现就是猝死，从尸检才发现心肌肥厚。就算携带同一个基因变异的肥厚型心肌病患者都可以有差别很大的表现。
所以携带着变异基因就相当于带了一个不知道什么时候可能发病的炸弹。为了让后代不携带变异基因，避免患病风险，最好的办法是进行遗传性阻断，优生优育。遗传性阻断目前有两种方法，一种是试管婴儿选择正常胚胎后受孕，另外一种是怀孕后羊水穿刺检测胚胎是否有基因突变，如果带有基因突变，可能需要流产，羊水穿刺本身也有1%的流产可能。试管婴儿可以更加提前一步进行遗传阻断，避免母亲流产的痛苦。
试管婴儿方法进行遗传阻断的原理和过程
遗传阻断就是永久性阻断。遗传性的肥厚型心肌病经过遗传阻断后不会传递给下一代，没有遗传性的突变是不会传递给下一代。目前，阜外医院和北医三院已经开始合作开展遗传阻断的试管婴儿项目。首先由阜外医院进行肥厚型心肌病基因评估，病情评估，并给出阻断基因的意见；再由北医三院进行试管婴儿。
胚胎植入前遗传诊断是指在胚胎植入前，分离其中 一个或少数几个细胞进行遗传疾病的诊断，挑选正常的胚胎进行移植。因为植入前胚胎细胞数量少而珍贵，所以特别需要单细胞检测技术。达到避免遗传疾病患儿出生又能避免孕妇引产的目的，另一方面，通过淘汰体外发育过程产生遗传异常的胚胎，提高试管婴儿成功率。
遗传阻断总体过程大致如下：
1.肥厚型心肌病确诊患者取血进行基因测序，检测肥厚型心肌病相关的基因，找出突变点。
2.尽可能多的家庭成员取血验证突变点，并进行超声、心电图、24小时心电图等检查。这样做有两个目的：一是为了查清楚该变异基因的作用效果到底是怎么样，它在肥厚型心肌病的发病中占了多大作用，确认就是由于该基因引起的肥厚型心肌病；二是尽早帮助患者家庭找出基因变异的家人，及时预防和治疗。越多的家庭成员接受检查，医生对变异基因的了解就更精确，更有把握进行胚胎选择。
基因检测费用大约需要8千元人民币，包括肥厚型心肌病先证者基因检测和其父母的验证。家系其他人的基因验证费用，每人大概几百元人民币。基因检测结果1-3月出检测结果，3个月出正式检测报告。
3.北医三院进行试管婴儿。根据遗传诊断结果，在植入胚胎前选择没有携带变异基因的胚胎植入孕妇体内，从而实现后代不携带变异基因。
试管婴儿费用大概为10～16万，周期是正常一次怀孕时间。前期需要在北医三院就诊，需要住院3～5次，每次大概住院1周(进行激素促进排卵，体外受精，取母体胚胎细胞进行检测等)。各个步骤有一段时间间隔，这段时间患者没必要住院。植入正常胚胎细胞，妊娠成功后就不需要频繁就诊，具体情况需具体分析。
如果是女性患者，需要评估病情，评估女性身体状况，是否适合做试管婴儿。怀孕对肥厚性心肌病可能加重，而严重程度肥厚型心肌病不适合怀孕。同时需要做生育力检查。
遗传阻断的成功率及过程可能会发生的问题
遗传阻断是通过选择无突变基因的胚胎进行胚胎移植，在试管婴儿基础上多了一步选择胚胎细胞，理论上成功率和普通试管婴儿一样。但遗传阻断目前没有一个比较准确的成功率。这是因为每个人的个体差异，特别是大龄、女性患者成功可能要低，不能一概而论。另一个原因是该技术是14年9月以后才开始正式进行，用于肥厚型心肌病的遗传阻断刚1年，所以样本量不足。
在进行遗传阻断过程可能发生以下问题：
1.找不到基因突变：肥厚型心肌病不是由于基因突变引起，或者是因为目前认识还无法确认的基因突变引起。
2.找到可能基因突变，但不能完全确认致病性。基因检测找到了有意义的基因突变，但是在家系筛查时候发现突变基因的致病性不明确，就是说家系里有很多人带了突变但是不发病，甚至只有先证者一个人发病。这时候需要扩大家系检测，才能比较确定地确认基因的致病性。这需要患者家庭亲戚成员配合检测，以便医生做到最大把握确认致病基因，防治选错阻断基因，杜绝做了后代遗传阻断依然发病的情况。
3.一次体外受精后培养检测无正常胚胎细胞。理论上如果患者只带一个突变基因，有一半地胚胎细胞是正常的，很大概率一次就能有正常胚胎。但是也有不幸的情况，就是第一次体外受精培养后，所有的受精卵均是带基因突变的，那需要做第二次。
4.选择正常胚胎细胞后无法正常受孕。已经挑选出正常的胚胎细胞，但是植入子宫后，母亲未妊娠。这种情况少见，原因也未确定。
5.其他的问题就是和正常怀孕可能出现的问题一样。
