机器学习——条件决策树

使用威斯康星州乳腺癌数据,划分训练集和测试集,比较经典决策树和条件决策树的效果。

条件决策树

算法如下:

(1) 对输出变量与每个预测变量间的关系计算p值。

(2) 选取p值最小的变量。

(3) 在因变量与被选中的变量间尝试所有可能的二元分割(通过排列检验),并选取最显著的分割。

(4) 将数据集分成两群,并对每个子群重复上述步骤。

(5) 重复直至所有分割都不显著或已到达最小节点为止。

条件推断树可由party包中的ctree()函数获得:

library(party)

fit.ctree <- ctree(class~., data=df.train)

plot(fit.ctree, main="Conditional Inference Tree")

ctree.pred <- predict(fit.ctree, df.validate, type="response")

ctree.perf <- table(df.validate$class, ctree.pred,dnn=c("Actual", "Predicted"))

ctree.perf

注:

值得注意的是,对于条件推断树来说,剪枝不是必需的,其生成过程相对更自动化一些。另外,party包也提供了许多图像参数。

下图展示了一棵条件推断树,每个节点中的阴影区域代表这个节点对应的恶性肿瘤比例。

predict()函数用来对验证集中的观测点分类。结果给出了实际类别与预测类别的交叉表。整体来看,条件决策树中验证集中的准确率是95.2381%,经典决策树的准确率是96%。

尽管在这个例子中,传统决策树和条件推断树的准确度比较相似,但有时它们可能会很不一样。

总结

· rpart包的处理方式:

首先对所有自变量和所有分割点进行评估,最佳的选择是使分割后组内的数据更为"一致"(pure)。这里的"一致"是指组内数据的因变量取值变异较小。

rpart包对这种"一致"性的默认度量是Gini值("吉尼系数"也可以用来衡量样本数据集的纯度。

吉尼系数越小,则表示该节点可以有效的把同一类聚集在一起。反之,分割后的类别越杂乱,则吉尼系数会越大。

在决策树生成时,当用到吉尼系数这个方法时,通常会计算每一个特征的吉尼系数,接着比较各个特征下的吉尼系数,系数越小的特征越适合先作为内部节点。)。

确定停止划分的参数有很多(参见rpart.control),确定这些参数是非常重要而微妙的,因为划分越细,模型越复杂,越容易出现过度拟合的情况,而划分过粗,又会出现拟合不足。

处理这个问题通常是使用"剪枝"(prune)方法。即先建立一个划分较细较为复杂的树模型,再根据交叉检验(Cross-Validation)的方法来估计不同"剪枝"条件下,各模型的误差,选择误差最小的树模型。

· party包的处理方式:

它的背景理论是"条件推断决策树"(conditional inference trees):它根据统计检验来确定自变量和分割点的选择。

即先假设所有自变量与因变量均独立。再对它们进行卡方独立检验,检验P值小于阀值的自变量加入模型,相关性最强的自变量作为第一次分割的自变量。自变量选择好后,用置换检验来选择分割点。

用party包建立的决策树不需要剪枝,因为阀值就决定了模型的复杂程度。所以如何决定阀值参数是非常重要的(参见ctree_control)。较为流行的做法是取不同的参数值进行交叉检验,选择误差最小的模型参数。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 203,937评论 6 478
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 85,503评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 150,712评论 0 337
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,668评论 1 276
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,677评论 5 366
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,601评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,975评论 3 396
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,637评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,881评论 1 298
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,621评论 2 321
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,710评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,387评论 4 319
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,971评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,947评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,189评论 1 260
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 44,805评论 2 349
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,449评论 2 342

推荐阅读更多精彩内容