Condón, F., Gustus, C., Rasmusson, D.C., and Smith, K.P. 2008. Effect of Advanced Cycle Breeding on Genetic Diversity in Barley Breeding Germplasm. Crop Sci. 48(3): 1027. doi:10.2135/cropsci2007.07.0415.
强调在封闭群体中（高级周期育种【Advanced Cycle Breeding】）优良亲本间杂交的植物育种被认为会降低遗传多样性。为了评估植物育种对等位基因多样性的影响，我们利用系谱信息、70个简单序列重复（SSR）标记和一个基因特异性标记，评估了明尼苏达大学六棱大麦（Hordeum vulgare L）育种计划在1958年至1998年间的区域祖先、亲本系和候选品种。系谱和SSR等位基因多样性指数显示，遗传多样性有所下降，从祖先群体的平均每个基因座5.89个等位基因到育种第四个十年的每个基因座2.34个等位基因。对应分析表明【correspondence analysis】，随着时间的推移，种质资源存在分化。在特定的基因座上，我们同时检测到等位基因的数量随着时间的推移而减少和没有变化。几个显示等位基因数量减少的标记基因座与抗病性或麦芽品质的主要基因座相关，推测在育种过程中正在进行选择。在育种种质中，对整个基因组的位点特异性等位基因变异的评估应确定应保存的基因组区域和有机会导入新等位基因多样性而不破坏理想的基因复合物的基因组区域。
