详解编辑距离(Edit Distance)及其代码实现

概述

编辑距离(Minimum Edit Distance,MED),由俄罗斯科学家 Vladimir Levenshtein 在1965年提出,也因此而得名 Levenshtein Distance。

在信息论、语言学和计算机科学领域,Levenshtein Distance 是用来度量两个序列相似程度的指标。通俗地来讲,编辑距离指的是在两个单词<w_1,w_2>之间,由其中一个单词w_1转换为另一个单词w_2所需要的最少单字符编辑操作次数。

在这里定义的单字符编辑操作有且仅有三种:

  • 插入(Insertion)
  • 删除(Deletion)
  • 替换(Substitution)

譬如,"kitten" 和 "sitting" 这两个单词,由 "kitten" 转换为 "sitting" 需要的最少单字符编辑操作有:

1.kitten → sitten (substitution of "s" for "k")
2.sitten → sittin (substitution of "i" for "e")
3.sittin → sitting (insertion of "g" at the end)

因此,"kitten" 和 "sitting" 这两个单词之间的编辑距离为 3 。

形式化定义

我们将两个字符串 a,b 的 Levenshtein Distance 表示为 lev_{a,b}(|a|, |b|),其中|a||b| 分别对应a,b 的长度。那么,在这里两个字符串 a,b 的 Levenshtein Distance,即 lev_{a,b}(|a|, |b|) 可用如下的数学语言描述:

  • 定义 lev_{a,b}(i, j) 指的是 ai 个字符bj 个字符之间的距离。为了方便理解,这里的i,j可以看作是a,b的长度。这里的字符串的第一个字符 index 从 1 开始(实际因为在表上运算的时候字符串前需要补 0),因此最后的编辑距离便是 i = |a|, j = |b| 时的距离: lev_{a,b}(|a|, |b|)

  • min(i, j) = 0 的时候,对应着字符串ai 个字符和 字符串bj 个字符,此时的 i,j 有一个值为 0 ,表示字符串 a 和 b 中有一个为空串,那么从 a 转换到 b 只需要进行max(i, j)次单字符编辑操作即可,所以它们之间的编辑距离为 max(i, j),即 i, j 中的最大者。

  • min(i, j) \ne 0 的时候,lev_{a,b}(|a|, |b|) 为如下三种情况的最小值:
    1.lev_{a,b}(i-1, j) + 1 表示 删除 a_i
    2.lev_{a,b}(i, j-1) + 1 表示 插入 b_j
    3.lev_{a,b}(i-1, j-1)+1_{(a_i \ne b_j)} 表示 替换 b_j

  • 1_{(a_i \ne b_j)} 为一个指示函数,表示当 a_i = b_j 的时候取 0 ;当 a_i \ne b_j 的时候,其值为 1。

过程示例

xxcxyz 为例,建立一个矩阵,通过矩阵记录计算好的距离:

min(i, j) = 0时,lev_{a,b}(i, j) = max(i, j),根据此初始化矩阵的第一行和第一列:

第一行(index = 0)初始化:
min(0, 0) = 0 ->  lev_{a, b}(0, 0) = max(0, 0) = 0
min(0, 1) = 0 ->  lev_{a, b}(0, 1) = max(0, 1) = 1
min(0, 2) = 0 ->  lev_{a, b}(0, 2) = max(0, 2) = 2
min(0, 3) = 0 ->  lev_{a, b}(0, 3) = max(0, 3) = 3

第一列(index = 0)初始化:
min(0, 0) = 0 ->  lev_{a, b}(0, 0) = max(0, 0) = 0
min(1, 0) = 0 ->  lev_{a, b}(1, 0) = max(1, 0) = 1
min(2, 0) = 0 ->  lev_{a, b}(2, 0) = max(2, 0) = 2
min(3, 0) = 0 ->  lev_{a, b}(3, 0) = max(3, 0) = 3

依据上面的公式可以继续推导出第二行:

第二行(index = 1)推导

min(1, 1) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(1, 1) = min(lev_{a, b}(0, 1)+1, lev_{a, b}(1, 0)+1, lev_{a, b}(0, 0)) = 0
min(1, 2) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(1, 2) = min(lev_{a, b}(0, 2)+1, lev_{a, b}(1, 1)+1, lev_{a, b}(0, 1)+1) = 1
min(1, 3) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(1, 3) = min(lev_{a, b}(0, 3)+1, lev_{a, b}(1, 2)+1, lev_{a, b}(0, 3)+1) = 2

继续迭代,第三行(index = 2)推导

min(2, 1) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(2, 1) = min(lev_{a, b}(1, 1)+1, lev_{a, b}(2, 0)+1, lev_{a, b}(1, 0)) = 1
min(2, 2) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(2, 2) = min(lev_{a, b}(1, 2)+1, lev_{a, b}(2, 1)+1, lev_{a, b}(1, 1)+1) = 1
min(2, 3) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(2, 3) = min(lev_{a, b}(1, 3)+1, lev_{a, b}(2, 2)+1, lev_{a, b}(1, 2)+1) = 2

直至推导出最终结果:

min(3, 1) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(3, 1) = min(lev_{a, b}(2, 1)+1, lev_{a, b}(3, 0)+1, lev_{a, b}(2, 0)+1) = 2
min(3, 2) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(3, 2) = min(lev_{a, b}(2, 2)+1, lev_{a, b}(3, 1)+1, lev_{a, b}(2, 1)+1) = 2
min(3, 3) \ne 0 \Rightarrow lev_{a, b}(3, 3) = min(lev_{a, b}(2, 3)+1, lev_{a, b}(3, 2)+1, lev_{a, b}(2, 2)+1) = 2

算法实现

1 递归方式

def Levenshtein_Distance_Recursive(str1, str2):

    if len(str1) == 0:
        return len(str2)
    elif len(str2) == 0:
        return len(str1)
    elif str1 == str2:
        return 0

    if str1[len(str1)-1] == str2[len(str2)-1]:
        d = 0
    else:
        d = 1
    
    return min(Levenshtein_Distance_Recursive(str1, str2[:-1]) + 1,
                Levenshtein_Distance_Recursive(str1[:-1], str2) + 1,
                Levenshtein_Distance_Recursive(str1[:-1], str2[:-1]) + d)

print(Levenshtein_Distance_Recursive("abc", "bd"))
>>>
2

2 动态规划
递归是从后向前分解,那与之相对的就是从前向后计算,逐渐推导出最终结果,此法被称之为动态规划,动态规划很适用于具有重叠计算性质的问题,但这个过程中会存储大量的中间计算的结果,一个好的动态规划算法会尽量减少空间复杂度。

def Levenshtein_Distance(str1, str2):
    """
    计算字符串 str1 和 str2 的编辑距离
    :param str1
    :param str2
    :return:
    """
    matrix = [[ i + j for j in range(len(str2) + 1)] for i in range(len(str1) + 1)]

    for i in range(1, len(str1)+1):
        for j in range(1, len(str2)+1):
            if(str1[i-1] == str2[j-1]):
                d = 0
            else:
                d = 1
            
            matrix[i][j] = min(matrix[i-1][j]+1, matrix[i][j-1]+1, matrix[i-1][j-1]+d)

    return matrix[len(str1)][len(str2)]


print(Levenshtein_Distance("abc", "bd"))

>>>
2

应用与思考

编辑距离是NLP基本的度量文本相似度的算法,可以作为文本相似任务的重要特征之一,其可应用于诸如拼写检查、论文查重、基因序列分析等多个方面。但是其缺点也很明显,算法基于文本自身的结构去计算,并没有办法获取到语义层面的信息。

由于需要利用矩阵,故空间复杂度为O(MN)。这个在两个字符串都比较短小的情况下,能获得不错的性能。不过,如果字符串比较长的情况下,就需要极大的空间存放矩阵。例如:两个字符串都是20000字符,则 LD 矩阵的大小为:20000 * 20000 * 2=800000000 Byte=800MB。

参考文献

[1] https://blog.csdn.net/ghsau/article/details/78903076
[2] https://en.wikipedia.org/wiki/Levenshtein_distance
[3] https://www.dreamxu.com/books/dsa/dp/edit-distance.html
[4] https://www.jianshu.com/p/a96095aa92bc

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