今天看了篇文章,颇有感触。
什么是代谢组学?
从一个小故事讲起,一位学者是做胰岛素信号转导MAPK通路中的ERK和JNK途径研究的。他向他做代谢组学研究的朋友请教,什么是代谢组学?他的研究如何与代谢组学结合起来?
代替回答他,朋友问了他以下两个问题,跟肥胖表型相关的一共有多少个基因多少条通路?他所研究的JNK途径对于一个肥胖表型的发生大致贡献率是多大?学者是很难回答这个问题的。
这就好比从A地出发去机场,可以去的路有无数条,如果你在有限的时间内需要在晚高峰的时候出发去赶飞机。你走那条路能最快到机场?甲乙丙三个人可能会因为各自对A-机场的了解而做出不同的选择(经验选择)。然而有一个简单的方法就是看GPS导航,选择一条拥堵没那么严重,预估到达时间合理的路线。与GPS从外太空发来的客观数据比较,经验值显得就弱一些了,因为你可能对也可能错。而GPS确实告诉你一个客观的事实,最后开车开过去,过五关斩六将还是得靠你自己。
代谢组学的功能,就有点类似GPS。代谢组学不做任何假设,针对样本和参照物分别进行代谢物全谱检测,帮你寻找出与差异代谢物,可能会有好几十个甚至更多,从它们所在的被上调或下调的代谢通路上去找到关键的代谢酶,再找到它们上游的调控基因,再进行后续的深入研究,是不是可以避免走一些弯路?可以说代谢组学是一个相当有效率的研究工具。代谢组学在生物标志物的发现,疾病早期诊断和预测,药物或营养干预的评价,药物毒性评价,代谢工程研究中均有应用,但代谢组学仅仅是一个“检测平台”,它无法独立开展机制性研究,但是如果合理的将代谢组学与分子生物学等学科协同使用,就可以起到事半功倍的作用。
说完这些,再回答学者的问题,就好比当下你认为ERK和JNK途径跟肥胖有非常重要的关系,有可能是对的也有可能是错的。但是假设我们用代谢组学的方法来讲肥胖症患者与对照组做个代谢物全谱检测,是不是能够助力一下你的研究?