故事主要讲诉的是一个透明人的一天。
一开场，主角纯子从医务室的床上醒来。来到教室后发现大家聚在一起议论纷纷。老师还让人收了她桌子上的东西。说话也没人搭理。桌上被摆放上菊花。同学们还集体哭泣默哀起来。纯子想着大家一定在开玩笑可伸手去拍好友小丽时手却直接从身体穿了过去。又试了几次还是一样的结果。她成了一个透明人。连门都可以穿过去。
再次来到医务室才发现床上居然还躺着一个自己，顿时懵了。想想自己才十六岁啊！连男朋友都没有谈过。还有很多美好的事情等着去体验。怎么能就这样走了呢？正在悲伤时，教务主任和医务室老师走了进来。他们看着躺着的纯子说出她致死的原因。原来纯子是从楼下跳下去的。可她怎么都不记得了呢？
这时教导主任出去接电话，医务室老师居然偷偷得说：“要死怎么不死远点？给我们添这么多麻烦。”纯子惊呆了。这还是平时那个温柔可人的美女老师吗？之后她跟着教导主任来到外面。想看看他准备怎么处理。没想到他却偷偷摸摸拨通了一个男人的号码。接电话的却是纯子的母亲。两人的关系居然很不简单。纯子欲哭无泪。
原来自己一直像个傻瓜一样。活在满是虚伪的世界里。想着想着就来到了楼上。突然想起自己不是跳楼自杀而是被别人推下楼的。于是来到教室想要找出凶手。发现刚才还在为自己痛哭流涕的同学。这时却都在说坏话。什么好朋友啊！全是假的。
各种难听的话语让纯子心痛不已。身体渐渐开始变淡了。他害怕就这样死掉。来到医务室哭泣。这时校长带着教导主任等一众老师出现了。讨论着要怎样才能把这件事情隐瞒下去。不能报警影响学校的名誉。纯子心都凉了。
自己都死了却没有一个人为她说话，想的都是利益。这时门被推开了。情绪激动地好友小丽走了进来说：“纯子不是自杀，而是被她推下楼的。”接着就跑到了楼顶。所有人都追了过来。这才知道事情的原因。
小丽在班里一直被人孤立。只有纯子愿意和她做朋友。但是在某一天校霸们欺负小丽时。纯子害怕受牵连，就没有坚定自己的立场。撇下了小丽独自离开了。想到这里纯子觉得自己和校长他们一样的恶心。都是为了利益伤害别人的人。
这时小丽却说她虽然恨纯子却没有想过让她去死。她无法原谅自己选择自杀谢罪。情急之下的纯子想要伸手去抓没想到真的抓住了她的手。小丽得救了。纯子的灵魂却在掉下楼的瞬间淡化消失了。
而医务室里的纯子却奇迹般的活了过来。赶忙跑到楼里和小丽握手言和。而教导主任看到死而复生的纯子吓得从楼上掉了下去。
画面一转，医务室中教导主任的灵魂站了起来。看着床上的自己吓了一大跳。看来他也要体验一下透明人的一天了。
故事到此结束。看了这部电影不经想到我们身边有多少人是口蜜腹剑的伪君子。每一个笑脸背后又有多少是真心实意。我们生活在一个个怎样的骗局当中？真应了那句：难得糊涂才是大智慧啊！
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