Hello，各位小伙伴们，我是喵学姐，有段时间没有推出生信之类的知识啦。没错，在今天的这期课程里，TCGA、GEO、PPI网络、以及LASSO分析、机器学习模型等等，这些，我们…….都不讲，咳咳…….
我们今天跟大家推出一个新的方向：网络药理学
网络药理学主要是干什么的了。大家先看下面这张图。
各位小伙伴能看出是什么吗？没错，通俗点讲就是“牙箍”，专业点叫“托槽”。把它们固定到你的牙齿上，让你那参差不齐的牙齿排排坐，就叫“口腔正畸”。
无论是左边这种可见牙箍，还是右边隐形的，都能够让你变得美美哒，向这个世界微笑。（是不是觉得下一秒喵学姐就要打广告了？）
可是，在你看不见的地方，可能你的牙齿是…….下面这样式儿的！！！可能松动了，也可能….连牙根都看不见了…..
以上这种现象，叫做“牙根吸收”，正如字面意思，就是我们的牙根不见了。
牙根吸收是矫正牙齿或者口腔正畸过程中，很大程度无法避免的一个并发症。
除了口腔正畸的原因，其他如牙髓炎、根尖周炎、外伤等原因，均可造成我们的牙根出现吸收现象。牙根吸收可能导致疼痛、萎缩和炎症感染，严重者可使牙齿脱落。可见，牙根吸收还是很可怕的，所以平时就需要保护好我们的牙齿哦。
那这跟网络药理学有什么关系了？
当然有关系。如果我们平时能做一些措施，就能很好的预防牙根吸收；或者牙齿出现牙根吸收后及时治疗，就能很好的保护好我们的牙齿。以免30岁的脸上、长着60岁的牙齿。你说是不是很有关系…..（喵学姐不允许你反驳）
这时候就要引出我们的主人公：网络药理学
顾名思义，网络+药理，不过网络药理学的研究是药在前，网络在后。
也就是说要先找到药，才能构建一个网络。
找什么药了？当然是找出可能治疗牙根吸收的药啦。西药也好，中成药也好，总之就是找到就行。中国文化博大精深，相信我们找个中成药，应该不是难事。
网络药理学元素：
接下来就需要欣赏下面这个图，这就是网络图，以喵学姐的审美，只能画成这样啦…
元素重点介绍：
首先喵学姐找到了一个可能治疗牙根吸收的中成药：红花。
蓝色的模块，是按照口服生物利用度和类药性，筛出的红花里有效的一些活性成分。中成药包含少则几种，多则几十、上百种的活性成分。因此我们首先需要筛选出最有可能发挥功效的那些成分，一般根据口服利用度≥30%、类药性原则≥0.18进行筛选。可以看出，上图中主要有2个成分，与网络中的其他元素关联线更多。
中间部分的绿色模块基因是这些活性成分可能作用的靶点，也就是说，这些成分可能通过调控这些基因，而发挥作用。活性成分的作用靶点有很多，成百上千，但并不是每一个靶点都有作用价值，因此需要通过各种方法进一步筛选、过滤无效基因。
此外，喵学姐也查找了跟牙根吸收相关的标志物。进一步从牙根吸收相关的标志物中，筛选出与活性成分靶点一致的标志物。通过一系列过滤方法，最终筛选出上述绿色模块中的23个基因。
进一步，通过通路分析，预测到23个共同的标志物可能参与的信号通路为Th细胞分化。
而图中所示的红色圈中的4个绿色模块基因，为最终确定的：即与活性成分有关、又与疾病相关、又与通路相关的最重要标志物。
因此，通过此网络，我们可以推测：红花可能主要通过2个有效成分，调控4个基因，通过参与Th细胞分化，最终达到抑制牙根吸收的目的。
喵学姐过后经过文献调研，证实上述推测可成立。Th细胞分化与形成增多，可通过促进破骨细胞分化、而促进牙根吸收的目的。因此我们后续可以通过分子实验进一步按照此机制路线进行验证。
综上可看出网络药理学大致分为如下几步：
网络药理学，相比于生信分析，在复杂性、入门难度等方面，可接受性比较好。网络药理学，重在揭示药物治疗疾病的机制探索。
网络药理学不仅适合于肿瘤类疾病，也同样适合非肿瘤疾病的分析。不仅可分析西药，也可分析中成药。网络药理学，在进行肿瘤类疾病的生信分析时也可适当引入，丰富研究内容。是时候看下网络药理学的文献啦，为自己的知识储备库添砖加瓦。
