【文献速递】nature及子刊文献单细胞空间组学双周更2023-04-03


人类胎盘(胚胎外器官)与蜕膜(子宫粘膜层)之间的关系对于孕期胎儿发育和保护胎儿至关重要。来自胎盘绒毛的绒毛外滋养层细胞 (EVT) 渗入蜕膜,将母体动脉转化为高导血管。妊娠早期滋养层细胞侵袭和动脉转化缺陷是先兆子痫等常见妊娠疾病的基础. 在这里,我们生成了包括子宫肌层在内的整个人类母胎界面的空间分辨多组学单细胞图谱,这使我们能够解析滋养层细胞分化的完整轨迹。我们已使用此细胞图谱推断可能介导EVT 入侵的转录因子,并表明它们保存在 EVT 从初级滋养层类器官和滋养层干细胞分化的体外模型中. 我们定义了滋养细胞侵入的最终细胞状态的转录组:胎盘床巨细胞(融合多核 EVT)和血管内 EVT(在母体动脉内形成栓塞)。我们预测有助于滋养细胞侵袭和胎盘床巨细胞形成的细胞间通讯事件,并模拟间质 EVT 和血管内 EVT 在妊娠早期介导动脉转化中的双重作用。总之,我们的数据提供了对植入后滋养细胞分化的综合分析,可用于为早孕期人胎盘实验模型的设计提供信息。

长期以来,了解自己的行为状态一直被认为对于将动态感官线索情境化和识别适当的未来行为至关重要。投射到大脑的运动系统中的上行神经元 (AN) 可以很好地提供此类行为状态信号。然而,AN 编码什么以及它们将这些信号传送到哪里仍然很大程度上未知。在这里,通过行为动物的大规模功能成像和形态量化,我们报告了成年果蝇Drosophila melanogaster中数百种可遗传识别的 AN 的行为编码和大脑靶向. 我们发现 ANs 对行为状态进行编码,特别是将自我运动传递到前腹外侧原大脑(一个综合感觉中枢),以及将离散动作传递到下颚神经节(一个动作选择位点)。此外,运动系统内的 AN 投影模式可预测其编码。因此,上升的种群能够很好地通知不同的大脑中枢自我运动和正在进行的行为,并可能为适应性行为所需的计算提供重要的基础。

反应性星形胶质细胞在神经系统疾病中发挥重要作用,但它们在癫痫中的分子和功能表型尚不清楚。在这里,我们表明,在颞叶癫痫 (TLE) 患者和癫痫小鼠模型中,星形胶质细胞中过度的脂质积累导致脂质积累反应性星形胶质细胞 (LARAs) 的形成,这是一种新的反应性星形胶质细胞亚型,其特征是 APOE 表达升高。APOE基因敲除抑制癫痫小鼠的 LARA 形成和癫痫发作活动。TLE 患者的单核 RNA 测序证实了具有独特分子特征的 LARA 亚群的存在。癫痫小鼠模型和人脑切片的功能研究表明,LARAs 促进神经元过度活跃和疾病进展。因此,通过干预脂质转运和代谢来靶向 LARA 可以为耐药性 TLE 提供新的治疗选择。


动物模型中的无任务功能连接提供了一个实验框架来检查受控条件下的连接现象,并允许与在侵入性或终端程序下收集的数据模式进行比较。目前,动物采集是通过不同的协议和分析进行的,这些协议和分析阻碍了结果的比较和整合。在这里,我们介绍 StandardRat,这是一种在 20 个中心测试的共识大鼠功能性磁共振成像采集协议。为了开发具有优化的采集和处理参数的协议,我们最初汇总了从 46 个中心的大鼠获得的 65 个功能成像数据集。我们开发了一个可重复的管道来分析通过不同协议获取的大鼠数据,并确定了与跨中心功能连接的稳健检测相关的实验和处理参数。我们表明,标准化协议增强了相对于先前收购的生物学上合理的功能连接模式。此处描述的协议和处理管道与神经影像学社区公开共享,以促进互操作性和合作,以应对神经科学中最重要的挑战。

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