这部长篇延续了该作者《鱼舟》的设定，未来世界，海洋淹没大片陆地，人类社会分为陆上民和海上民。为了活下去，我们改变了自己的基因表达，于是，每个海上民出生的时候，他的“朋”也和他一起来到这个世界，只是，“朋”是鱼的形态。孩子的父母会留下人形的婴儿，放生鱼形的婴儿，许多年后，孩子长大成人，他的“朋”会从茫茫大海中找回来，成为他兄弟的鱼舟，从此，他们形影不离。人类在鱼舟上生活，鱼舟载着自己的兄弟遨游大海。
可是，并不是所有的人都能顺利等到的自己的“朋”，也不是所有的鱼舟都能回到兄弟身边。尤其是病潮病毒肆虐，海上民生存艰难的当今，许多人选择到陆上寻求更好的生活，于是，他们的“朋”只能在海中徘徊，最终走上陆地，变成兽舟...
作者用独有的细腻笔锋，描绘了一个风雨飘摇的未来世界，她笔下的地球仿佛是一个脆弱的玻璃珠，晶莹剔透，随时可能会破碎。在这个玻璃球上，人类群体中依然上演着勾心斗角，权争利斗。故事的底色是孤寂的，缥缈的，阅读时，作者的文字化为有生命的鱼舟，载着读者在浩瀚的海洋上飘荡，你知道海洋会终有一天会变成恐怖的怪兽，掀起惊涛骇浪将你吞噬。可是有鱼舟的陪伴，对于未来的恐惧被稀释。
这不是一个对抗世界末日的故事，主角并没有拯救世界，没有征伐宇宙的壮举也没有流浪地球的勇气。人只能努力在走向灭绝的路途中寻找生存的意义...
末世的设定更像是为吟唱人类感情的歌者搭建的宏大舞台。她描述的感情不激烈、不动荡，千言万语在一呼一吸间流淌。
书中其实设置了两组伙伴，海上民有自己的鱼舟，陆上民也有自己的辅助智能，他们都与自己的伙伴亲密无间，彼此完全信任。这种非人类的陪伴，从出生起就建立深深的羁绊，你中有我，我中有你，比起人类，更加纯粹亲昵，坚不可摧。
人的底色其实是孤独，人与人之间其实难以建立完全的信任依赖。但是，造物主为我们选择了伙伴，也许人人都有自己的伙伴，从出生起就和你有着深厚的羁绊，尽管你不知道。在长大后的某一天，你的伙伴会从茫茫人海中找到你，这个伙伴或许是一本书，或许是一只猫，或许是一只狗。
你和你的“朋”之间，依靠彼此间的灵魂共振交流，不会被任何人打扰窥探，伙伴将是最亲密的存在，陪伴你度过注定孤独的人生，这种陪伴甚至是超越生死的，让你在茫茫大海上不会害怕，不会迷茫。”
以下涉及剧透
鸿野是一位地球行星科学家，他和朋友星川一起研究了地球内部各项数据，提出，大陆架即将崩塌，地底甲烷气体泄漏，海平面将上升260米，淹没绝大部分的陆地。果不其然，被称为二次白垩化的灾难开始了，人类政府开始奔溃。世界大格局上分为陆地民和海上民，人来开始针对生物进行基因改造，包括人类在内。海上民住在鱼舟上，鱼舟有着扁平的头、两对鱼鳍，人们在她背上的巨大空穴中生活。
奈杰斯（政府组织）官员青澄和他的下属竹本还有我（我是马奇，青澄的辅助人工智能）来到AIR01上，这是一个远洋海上人造城市，他们要去查看一只新登陆的被击杀的兽舟。青澄发现兽舟表皮下有什么东西在蠕动，用燃烧弹击中后，发现里面是些像是老鼠一样活的生物，这些生物困在兽舟的骨架中，片刻后和兽舟一起变成焦土。竹本用人造鸟提取了一些残留液体。
几年前，青澄作为政府官员被派往陆地的一个村子，泛亚和泛欧想要征收这个村子的地，让青澄负责协调。一天，一个叫阿吉斯的村民找上青澄，有兽舟袭击了村子，青澄等不了警察，拿上霰弹枪和阿吉斯一起去了。村里的人都被兽舟杀害了，一个不小心，阿吉斯也被咬断喉咙，青澄失去了左腿。
我作为他的助理智能，远程协助他调节自己的肢体，人工脑和生物脑，分析整理数据信息。我和他相处的很愉快，我习惯了他的情感，觉得人类的情感像音乐一样。我们猜测，是想要村子的人嫌青澄谈判太慢，放任兽舟袭击了村子，阿吉斯有可能是引青澄入局的人，人类为了欲望，什么都会做，但，如今也没法证实。此后青澄换上了心理疾病，甚至发展为哮喘，得益于我的干预，才回归正常。但是我知道，对于这件事，青澄没有忘掉，（人类真是不可思议的生物。明明直接抛弃就好的事情，偏偏刻下比任何东西更强的记忆印记。人似乎并不一定会积极向上，他们常常停在同样的地方，原地转圈，在回答不出的问题面前苦恼不已。不过可以想见的是，如果完全否定这种性质，人类也就不成为人类了吧。他想忘记那个事故，但同时也绝不想忘记，人类的这种系统，背负着这样奇异的二律背反，居然不会发疯。这种复杂性或者敷衍性，是助理职能不具备的。）
第二天，青澄回到远洋公馆上班，他是AIRE01的公使，在这里，我和我的躯体会了面。竹本来汇报昨天击毙的兽舟提取液的情况，发现那些老鼠样子的生物身上的液体具有很高的燃点，需要很高温度才能杀死他们，用燃烧弹不一定有作用。青澄正要向桂大使汇报，大使先召见了他，告诉他，有一位海上民首领月染，她的船队多达上千只，人数上万，以分散的形式在大海上，她们以群体生物的形式组织起来，都接种了病潮疫苗（由六玉水母从深海带上来的病毒，致死率很高，水母上浮的时间地点不确定，成群上浮被称为病潮，病潮疫苗是陆地政府控制海上民，向海上民征税的重要手段）大使说为了防止其他接手的人采取暴力手段，希望青澄先跟月染接触，调节她们取得日本国籍并纳税。
青澄通过打捞公司的村野联系上了月染，她大概七十多岁了，但是看上去还是很年轻，她寄来一封用海上民古语写的信，我用同样的语言回信，她答应会面。我和青澄乘坐海上飞机到了见面地点，月染提出建立海上交易中心，提供生产疫苗的设备，疫苗交易的利润让给日本政府，但绝对不加入国籍。她表示，社会一旦稳定了，分歧和阶级就产生了。我们登上月染的鱼舟让叶，参观了海上集市，月染告诉我们，除了疫苗，海上贸易中心其实对陆上民也有利。因为缺乏必要生存物资和疫苗，海上民孩子的存活率下降，也就导致，这些孩子的鱼舟失去掌舵者，变成兽舟登上陆地，威胁陆上民的生存。青澄很欣赏月染，回到AIR01,他立刻草拟方案，和桂大使商议，提出显然疫苗免费，向月染争取海底城市资源，推进海上贸易中心建立。
月染小时候被陆上民江渡收养，跟着他环游世界，他们去到非洲，看到主动进化成黑色的卵状，退出食物链的袋人。后来江渡老了，为月染找到一个海上民家庭，给她留下一个箱子，让她离开了。收养月染的哈尼一家，教会月染捕鱼和在拟叶礁采集。一天，月染的兄弟的鱼舟找了回来，月染知道自己没有”伙伴“但还是唱起了很早以前学会的曲子，周围的鱼舟都被她吸引。船上的长老说，月染是织网者，织网者生下鱼舟不会放归大海，他们会和人形的孩子一起被养大，织网者的歌声可以沟通所有鱼舟。后来月染嫁给了船队首领朝木，收养了三个孩子，但是她的家人都死于一场突发的病潮。只有月染和少数人活了下来。月染成为了船队的首领，为了获得病潮疫苗，月染打开了江渡的箱子，里面的设备记录了二次白垩化前的海底资源分布，是一笔很大的财富，靠着这个，月染建立了疫苗交易商路，队伍扩充到上千人，每几十个鱼舟组成小队生活。月染调查了青澄，得知他不是道貌岸然的政府官员，对他很是欣赏。
提丰是一名海上武警察，是身上沾满斑纹的“绿子”，受到陆地民的歧视，爱好打扮自己的助理，负责击杀海盗。他的哥哥利是一名政府高官，通过路上政府针对海上民人才引进渠道进入高层。哥哥邀请提丰赴宴，晚饭后告诉他，亚细亚政府打算以清洗海盗的名头屠杀无辜的无国籍海上民，并且通过取得国籍的限制控制海上民。如此丧心病狂的方案已经通过，就要施行。提丰明白哥哥的意思，他们都是为了心中的理想来到陆上工作，提丰决定留在政府，尽可能利用职权帮助海上民。他回到自己的海上族群，收编了流离失所的孩子白原和他的鱼舟萨尔多尼卡。他将这个消息告诉了父母，告诉了族群首领，请他尽可能通知海上民，让大家逃到赤道附近。
我和青澄参加了一场高级别的晚宴，宴会中遇到了高傲的九郎委员，我们怀疑他和走私疫苗有关。桂大使前往内省汇报了我们关于建立海上交易中心的方案，开始很顺利，但是不久，桂大使就接到了调往内省的通知，顶替他的正是九郎，九郎告诉清澄，他们的方案黄了，暗示是因为桂大使有很多政敌。从桂大使处，清澄看到了海上民首领吉姆兰的消息，得知泛亚政府在滥杀海上民。清澄很震惊，想联系高层，最终联系上了提丰，从他的暗示中，得知是他将消息递给海上民，并在暗中保护海上民，提丰还暗示青澄去找自己的哥哥利。清澄拜托自己的哥哥搭关系。同时，让我在ssAI中搜素信息，这里有海量信息。我在这里遇到了同样搜素海上信息的小猎犬（书记官樱木的助理智能），他的程序更厉害，我们分享了信息。这时，我们遇到了“特殊公馆”普罗透斯特工组织成员米拉的智能助理南希，她的搜索速度更快，小猎犬经常埋伏在她身边，丢出干扰程序和窃听程序，抢夺她搜出来的信息，这次，我们得知，她在搜素月染的信息，并且要对她采取措施。
环境工程学家在明石海胆中发现了OX105细菌，猜测这种改善六玉水母的人造纳米机器，就是创造致死的明石海胆，还有催化兽舟的元凶，人类改变环境，目的在于让人类活下去，但同时也创造了许多生存的绊脚石。另外，研究所的科学家很还发现，地底地幔柱还在变化，大概五十年后泛亚地区将会发生大规模的火山爆发，海底涌出大量岩浆，火山灰遮蔽天空，人类走向灭绝，改变不了环境，人类只能进一步改造自己，提出对海上民的基因再次改造，让她们完全脱离人类形态，雌雄同体，能在深海生存的生物——露西。为了推行这个计划，政府当前采用将鱼舟兽舟一并赶尽杀绝的方法。对此，海上民也无能为力，人只能努力在走向灭绝的路途中寻找生存的意义。
我和小猎犬把从南希那里抢来的资料给了樱木书记官和清澄，打开发现是一个人工智能艾米利亚，她应该有关于月染的资料，因为南希是在检索月染的时候把她找出来的。清澄证明了自己和月染相识，艾米利亚告知了清澄一些信息，但是不多。樱木书记官对艾米利亚进行了进一步分析，发现了很重要的内容。一段记录表明，一位政府官员华莱士，在处理兽舟袭击人事件中，在兽舟藏身的洞穴中发现了几个孩子，经过救治，发现这些孩子不会说话，经过研究，发现这些孩子不是人类，而是由兽舟进化来的。他们被称为拟似人类，他们被交给政府研究。而月染，极有可能是一位“拟似人类”。
刚得知这个消息不久，普罗透斯的米拉就约了桂大使和清澄，他们要求清澄帮助普罗透斯定位月染，还告知他们，第二次世界灾难即将来临，大部分人类将不能生存。而月染，她的基因特殊，政府需要她，他们隐瞒了月染拟似人类的信息。清澄知道他们想要利用自己和月染的关系，但证实了他们所说的世界灾难真实性，陷入深深的绝望。于此同时，提丰组建小队，明面上执行政府命令，实际上尽自己最大努力拯救海上民。
清澄联系月染，想把月染交给泛亚而非普罗透斯，如果月染的基因可以拯救人类，他希望可以拯救更多的人。但月染察觉到海军对无标签海上民的绞杀，接见了其他船队的首领，打算带着船队南下前往公共海域。途中很多人留下，在顺着赤道洋流南下的时候，遭遇了海盗袭击，危难时刻，海上警卫队将海盗赶到海军包围圈，一只玛瑙色泽的小鱼舟出现，那是一民警卫队成员，他救了月染他们，并向他们提供了物资和武器。
青澄通过哥哥的朋友接触到了薛兰委员，他是个威严霸气的人，委员通过打壁球的方式考验青澄，青澄临时下载电子记忆，依靠自己的智慧通过了考验。在于委员交谈中，他提出，想要尽自己的力量拯救更多的人。委员认为他的想法很天真，但同时肯定了他，向他表露，提丰的哥哥利委员也是致力于拯救更多人的海上民出身。最后，薛兰表示，如果青澄从远洋公馆辞职，请他来担任自己的秘书。
针对海上民的屠杀愈演愈烈，海上民在港口组织了示威游行，提丰尽力阻挡在海上民和海军之间，他知道，只要他退出或者海上民有过激的行为，海军就有借口屠杀海上民。就在这个时候，他从薛兰那里得到消息，自己的哥哥已经被政府以贪污的借口带走，提丰知道自己也该逃走了，他带上警卫队、璨和月牙，逃了出去，但是海军以叛国罪要逮捕他，要让他和哥哥互相成为彼此的人质，他们发动攻击，逃了出去，但是，海军的追击很迅速。白原和他的伙伴萨尔多尼亚还有其他几位朋友为了掩护提丰，以身躯迎击海军潜艇，被无情击杀，月牙愤怒了，提丰不顾璨的阻拦，也决定反击。提丰、月牙还有璨通过脑部链接和驾船歌合为一体，带领剩下的人向着海军发起了最后冲锋，不幸遇难，他们的战斗引来了兽舟，最后，提丰、月牙和璨，三个不同的生命一起葬生在海底。
月染带领船队南下，期间遇到了兽舟，他们让鱼舟发出声音喝退兽舟，但是一路还是失去了很多同伴，最后来到了大洋洲附近的拟叶礁。但是当地物资也很匮乏，当地海上民不是很愿意接纳她们，她们也还是不敢相信大洋洲的政府。青澄听说了提丰的死很震惊愤怒，他和桂大使说服远洋公馆的领导，向上传达想要私自和月染接触，将她的基因秘密通过irea分享给全世界人类的想法，高层表面上同意和普罗透斯合作，但是暗地里为他们争取了十天时间。十天内，清澄辗转找到了月染，并把艾米利亚带到了月染面前，艾米利亚也叫琳迪，她是江渡(也就是华莱士）的助理智能，她协助江渡改造了月染的大脑，月染不属于陆上民也不是海上民，也不属于织网者，江渡被美洲政府间谍结构折磨致死，但她们始终保护着月染，艾米利亚封闭自己躲在网络中，最终被清澄发现。
月染同意了青澄的要求，但注射国籍标签后发现，随行户籍官员被米拉通过助理智能远程控制了。虽然国籍标签注射成功，但是青澄受了重伤，我也受到损坏，还出现了类似长臂猿的类人生物攻击我们。一艘潜艇正在缓缓靠近，击沉了我们的一艘潜艇，竹本指挥我们的潜艇和对方的潜艇都开启了反声纳侦察系统，互相探测不到，但是月染的伙伴让叶可以在700米内探测潜艇，而对方顾及月染不敢伤害让叶，最终，我们的潜艇在让叶的协助下，成功击沉了对方潜艇，但让叶也受了重伤，青澄和让叶一起请求iera的救助。
青澄伤好后，决定辞职，普罗透斯出于报复青澄的目的，将大洋洲和南下鱼舟之间的矛盾问题都抛给了清澄，青澄努力积极应对，但还是体力不支，差点过劳死。月染的让叶快要死了，月染卸下了首领的职位，将手中的海底资源信息交了出去。青澄在这个时候辞职，和村野还有海上浮萍，建立了海上救助网络，尽最大的努力救助海上民，以经济体的形式，成立海上交易中心，为地幔柱之冬做准备。
这个时候，桂大使找到了我们，告诉我们，政府想要拷贝一份我，让我和其他二十几个助理智能的拷贝一起，搭乘飞船，带者拟似人类的基因，飞向宇宙深处。这种体验很神奇，他们认为，我们作为助理智能，和主人一起生活的过程中，塑造了独特的人格，是人类历史和文明最好的见证者，而拟似人类有着更优良的基因和适应能力，青澄鼓励我，同意了拷贝要求。
四十八年后，地底熔岩爆发，很多城市被毁灭，兽舟和人类之间爆发争斗，人类和其他生物一样，平等的互相屠杀。被改造的人类——露西潜入海底，不再关心海面上的事情，她们也面临着严酷的生存考验。我和其他助理智能，从遥远的太空看着地球一点点被黑灰色颗粒覆盖包裹，带者对人类的祝福，去往了宇宙深处。此前我作为拷贝第一次见到了青澄，他已经七十多岁了。他告诉我，我是他最亲爱的搭档，他一直为拯救人类而奋斗，人类这种生物，所做的一切，都是为了能在最终时刻来临时，能平静地微笑面对死亡。
