MultiQC的安装
1.在已经安装conda的条件下安装multiqc
首先要进入conda环境
multiqc需要在特定的python包下才能运行,所以创建python27环境,在这个环境下运行multiqc
conda create --name python27 python=2.7 -y
conda activate python27
运行结果
2.进入环境后安装multiqc
conda install multiqc
运行结果
3.multiqc进行评价
先进行fastqc得到qc结果,再用multiqc进行评价
fastqc Akle_TTAGGC_L004_R1_001.fastq.gz
fastqc Akle_TTAGGC_L004_R2_001.fastq.gz
结果创建一个文件夹1119,将得到的2个zip文件放进去
multiqc -n 1119 ./
结果
得到1119_data和1119.html
结果
用浏览器打开