ToneScript cDNA第一链合成试剂盒是专门用于两步法RT-PCR的第一步,含有合成高质量第一链cDNA所需的所有成分,适用于后续的PCR、qPCR以及基因克隆。那么在实际操作中会有哪些常见问题呢?一起来了解一下:
1、 没有RT-PCR产物或产量低
◆RNA模板降解。RNA的纯度和完整对于反转录得到全长cDNA是非常重要的。提取的RNA应进行电泳检测以确定其是否降解。同时RNA要避免多次反复冻融。
◆RNA模板纯度低。提取RNA的过程中,可能残留一些盐离子、试剂,如EDTA、酚、胍盐、磷酸盐、多胺等抑制接下来的反转录反应。建议用75%乙醇(DEPC水配制)仔细清洗RNA沉淀。
◆引物不合适。选择合适的引物,当RNA是细菌RNA或者是没有polyA尾的RNA要选择随机引物或者特异引物。
◆目的基因含有复杂二级结构或高GC含量。建议选择随机引物进行反转录。将反转录温度提高至55℃。
2、RT-PCR产物比预期长
◆RNA中很可能污染了DNA。真核生物基因组DNA中含有内含子,可能参与了PCR扩增,可以在反转录之前对RNA进行DNaseI的消化。
3、阴性对照中有RT-PCR产物
◆阴性对照中有RT-PCR产物也表明有DNA的污染。在反转录之前对RNA进行DNase I的消化。