conda小环境的构建:
问题:小环境构建了之后会一直保存吗,再一次如何进入?
conda info --envs # 查看环境
conda create -n myenv # 创建一个环境
source activate myenv # 激活进入 myenv环境
conda deactivate # 退出当前环境
conda env remove --name myenv # 移除环境
安装软件
- 从conda网页内查找:http://bioconda.github.io/conda-recipe_index.html
- conda search PACKAGENAME:运行命令查找是否存在
- conda 安装R语言以及R包示例
conda info --envs # 查看环境conda create -n R3.5 # 创建名为R3.5的环境
source activate R3.5 conda list #查看当前安装的软件
conda install r-base #安装R语言
conda install r-stringi # R包 以 r- 开头
conda deactivate # 退出当前环境
-
安装指定版本
conda install numpy=1.11:即安装能模糊匹配到numpy版本为1.11 conda install numpy==1.11:即精确安装numpy为1.11的版本
调取帮助文档
继续调取conda子命令的帮助文档,如
conda create --help
conda install --help
其他
conda list:在当前小环境下,列举所有安装软件。
示例:
source activate rna
conda list
列举rna小环境内安装的所有软件
退出小环境
conda deactivate: linux下conda退出小环境命令
移除小环境
conda env remove --name bio-env:删除小环境及里面的内容