Spark 源码浅析之 Shuffer 写部分

Shuffle Write

TaskRunner 在启动 Driver 端发送过来的 Task 的时候,调用的是 Task.run() 方法,Task.run() 方法会调用 runTask() 方法来进行计算,runTask() 是由 Task 的子类来进行具体实现的:

final def run(
    taskAttemptId: Long,
    attemptNumber: Int,
    metricsSystem: MetricsSystem): T = {
    
  // 想 Executor 端 BlockManager 注册 Task
  SparkEnv.get.blockManager.registerTask(taskAttemptId)
    
  context = new TaskContextImpl(...)
    
  TaskContext.setTaskContext(context)
  taskThread = Thread.currentThread()

  new CallerContext(...).setCurrentContext()

  try { 
    // 进行计算
    runTask(context)
  }  // ... 
    
}

更多细节,参考上篇文章:Executor 和 Task 部分

ShuffleMapTask

Task 有 ShuffleMapTask 和 ResultTask 两个子类,这篇文章,我们讨论的是 Shuffle -Write 部分,需要用到的是ShuffleMapTask。

流程概览

ShuffleMapTask.runTask() 的实现细节:

override def runTask(context: TaskContext): MapStatus = {
  
  // ...
    
  var writer: ShuffleWriter[Any, Any] = null
  try {
    // 获取 Shuffle Manager
    val manager = SparkEnv.get.shuffleManager
   // 获取 Writer
    writer = manager.getWriter[Any, Any](dep.shuffleHandle, partitionId, context)
    // 将计算结果写出
    writer.write(rdd.iterator(partition, context).asInstanceOf[Iterator[_ <: Product2[Any, Any]]])
    writer.stop(success = true).get
  } catch {
    // ...
  }
}

由于后文需要,我们得先看下 manager.getWriter() 中传入的 dep.shuffleHandle 的实现细节:

val shuffleHandle: ShuffleHandle = _rdd.context.env.shuffleManager.registerShuffle(
  shuffleId, _rdd.partitions.length, this)

Spark 2.2.3 默认使用SortShuffleManager 作为 Shuffle 的管理端,SortShuffleManager.registerShuffle() 的实现细节:

override def registerShuffle[K, V, C](
    shuffleId: Int,
    numMaps: Int,
    dependency: ShuffleDependency[K, V, C]): ShuffleHandle = {
    
  if (SortShuffleWriter.shouldBypassMergeSort(conf, dependency)) {
    // 根据spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold的值(默认是200)
    // 判断是否需要进行 Map 的合操作
    // 如果 partitions 的个数小于 200 就不进行该操作
    new BypassMergeSortShuffleHandle[K, V](
      shuffleId, numMaps, dependency.asInstanceOf[ShuffleDependency[K, V, V]])
  } else if (SortShuffleManager.canUseSerializedShuffle(dependency)) {
    // 看看能不能使用序列化映射的形式映射
    new SerializedShuffleHandle[K, V](
      shuffleId, numMaps, dependency.asInstanceOf[ShuffleDependency[K, V, V]])
  } else {
    // 其它
    new BaseShuffleHandle(shuffleId, numMaps, dependency)
  }
  
}

SortShuffleManager 会根据配置和依赖的不同,实例化不同的 ShuffleHandle。

接下来,我们就看看 manager.getWriter() 方法的实现细节,也就是 SortShuffleManager.getWriter():

  override def getWriter[K, V](
      handle: ShuffleHandle,
      mapId: Int,
      context: TaskContext): ShuffleWriter[K, V] = {
    numMapsForShuffle.putIfAbsent(
      handle.shuffleId, handle.asInstanceOf[BaseShuffleHandle[_, _, _]].numMaps)
      
    val env = SparkEnv.get
    // 匹配 dep.shuffleHandle,选择实例化 Writer 对象
    handle match {
      case unsafeShuffleHandle: SerializedShuffleHandle[K @unchecked, V @unchecked] =>
        new UnsafeShuffleWriter(
          env.blockManager,
          shuffleBlockResolver.asInstanceOf[IndexShuffleBlockResolver],
          context.taskMemoryManager(),
          unsafeShuffleHandle,
          mapId,
          context,
          env.conf)
      case bypassMergeSortHandle: BypassMergeSortShuffleHandle[K @unchecked, V @unchecked] =>
        new BypassMergeSortShuffleWriter(
          env.blockManager,
          shuffleBlockResolver.asInstanceOf[IndexShuffleBlockResolver],
          bypassMergeSortHandle,
          mapId,
          context,
          env.conf)
      case other: BaseShuffleHandle[K @unchecked, V @unchecked, _] =>
        new SortShuffleWriter(shuffleBlockResolver, other, mapId, context)
    }
      
  }

SortShuffleManager.getWriter() 会根据 ShuffleHandle 的不同,实例化不同的 ShuffleWriter。

ShuffleMapTask.runTask() 获取到 ShuffleWriter 后,就会调用 ShuffleWriter.write() 方法将计算结果写出,这里我以 SortShuffleWriter 为例:

override def write(records: Iterator[Product2[K, V]]): Unit = {
 
  // 根据是否进行 Map 端的合并,创建不同类型的 ExternalSorter
  sorter = if (dep.mapSideCombine) {
    require(dep.aggregator.isDefined, "Map-side combine without Aggregator specified!")
    new ExternalSorter[K, V, C](
      context, dep.aggregator, Some(dep.partitioner), dep.keyOrdering, dep.serializer)
  } else {
    // In this case we pass neither an aggregator nor an ordering to the sorter, because we don't
    // care whether the keys get sorted in each partition; that will be done on the reduce side
    // if the operation being run is sortByKey.
    new ExternalSorter[K, V, V](
      context, aggregator = None, Some(dep.partitioner), ordering = None, dep.serializer)
  }
  // 向 ExternalSorter 插入全部数据
  sorter.insertAll(records)

  // 在 Shuffle 写入时,不会打开多个文件,只打开一个文件
  // 也就是所有的分区都写入到一个文件中
    
  // 获取数据写出的临时文件的输出流
  val output = shuffleBlockResolver.getDataFile(dep.shuffleId, mapId)
  val tmp = Utils.tempFileWith(output)
  try {
    val blockId = ShuffleBlockId(dep.shuffleId, mapId, IndexShuffleBlockResolver.NOOP_REDUCE_ID)
    // 将 ExternalSorter 中的所有数据写入到临时文件中
    val partitionLengths = sorter.writePartitionedFile(blockId, tmp)
    // 创建一个索引文件,记录每个块的偏移量和结束位置
    shuffleBlockResolver.writeIndexFileAndCommit(dep.shuffleId, mapId, partitionLengths, tmp)
    // 输出结果的信息
    mapStatus = MapStatus(blockManager.shuffleServerId, partitionLengths)
  } finally {
    if (tmp.exists() && !tmp.delete()) {
      logError(s"Error while deleting temp file ${tmp.getAbsolutePath}")
    }
  }
}

我们先看下 ExternalSorter 的使用说明,在 ExternalSorter 类的注释中:

Users interact with this class in the following way:

1. Instantiate an ExternalSorter.

2. Call insertAll() with a set of records.

// 调用 iterator() 方法获取排序/聚集后的结果
// 或者调用 writePartitionedFile() 方法,将排序/聚集后的数据写出
3. Request an iterator() back to traverse sorted/aggregated records.
    - or -
   Invoke writePartitionedFile() to create a file containing sorted/aggregated outputs
   that can be used in Spark's sort shuffle.

我们先看下 ExternalSorter.insertAll() 的实现细节:

def insertAll(records: Iterator[Product2[K, V]]): Unit = {
  // TODO: stop combining if we find that the reduction factor isn't high
  val shouldCombine = aggregator.isDefined
  // 在 Map 端进行合并
  if (shouldCombine) {
    // 首先使用 AppendOnlyMap 在内存中合并
    val mergeValue = aggregator.get.mergeValue
    val createCombiner = aggregator.get.createCombiner
    var kv: Product2[K, V] = null
    // update 函数
    val update = (hadValue: Boolean, oldValue: C) => {
      // 如果 key 已经存在,就使用 mergeValue 行聚合操作
      // 如果不存在,就使用 createCombiner() 方法进行初始化操作
      if (hadValue) mergeValue(oldValue, kv._2) else createCombiner(kv._2)
    }
    // 如果记录中有值
    while (records.hasNext) {
      addElementsRead()
      // 获取 key-value
      kv = records.next()
      // map 是 PartitionedAppendOnlyMap 的实例化对象
      map.changeValue((getPartition(kv._1), kv._1), update)
      // 是否进行 Spill 操作
      maybeSpillCollection(usingMap = true)
    }
  } else {
    // 不进行 Map 端合并
    while (records.hasNext) {
      addElementsRead()
      // 获取 key-value
      val kv = records.next()
      // 向缓存区中写入
      buffer.insert(getPartition(kv._1), kv._1, kv._2.asInstanceOf[C])
      // 是否进行 Spill 操作
      maybeSpillCollection(usingMap = false)
    }
  }
}

ExternalSorter.insertAll() 将任务分为需要 map 端聚合和不需要 map 端聚合两种情况,分别进行处理。

在 map 端进行聚合是由 map.changeValue() 方法来完成的,map 是 PartitionedAppendOnlyMap 的实例化对象。

类关系

changeValue() 方法是在 AppendOnlyMap 中进行的实现:

def changeValue(key: K, updateFunc: (Boolean, V) => V): V = {
    
  // ...
    
  var pos = rehash(k.hashCode) & mask
  var i = 1
  while (true) {
    // data 是一个存储 key 和 value 的数组,格式为:key0, value0, key1, value1...
    // key = 2 * pos,value = 2 * pos + 1
    val curKey = data(2 * pos)
    if (curKey.eq(null)) { // key 不存在   
     // 进行 createCombiner 操作
      val newValue = updateFunc(false, null.asInstanceOf[V])
      data(2 * pos) = k
      data(2 * pos + 1) = newValue.asInstanceOf[AnyRef]
      incrementSize()
      return newValue
    } else if (k.eq(curKey) || k.equals(curKey)) {  // key 存在  
      // 进行 mergeValue 操作
      val newValue = updateFunc(true, data(2 * pos + 1).asInstanceOf[V])
      data(2 * pos + 1) = newValue.asInstanceOf[AnyRef]
      return newValue
    } else {
      val delta = i
      pos = (pos + delta) & mask
      i += 1
    }
  }
  null.asInstanceOf[V] // Never reached but needed to keep compiler happy
}

不在 map 端进行聚合就会通过 buffer.insert() 方法,将数据插入到缓存去中,buffer 是 PartitionedPairBuffer 的实例化对象。

类关系图

PartitionedPairBuffer.insert():

def insert(partition: Int, key: K, value: V): Unit = {
  if (curSize == capacity) { // 达到容量
    // 扩容
    growArray()
  }
  // 以 (partition, key) 元组的形式存储
  data(2 * curSize) = (partition, key.asInstanceOf[AnyRef])
  // 存储 value
  data(2 * curSize + 1) = value.asInstanceOf[AnyRef]
  curSize += 1
  afterUpdate()
}

在执行完 map.changeValue() 和 buffer.insert() 操作后都调用了 maybeSpillCollection() 方法来判断是否执行溢写操作:

private def maybeSpillCollection(usingMap: Boolean): Unit = {
  var estimatedSize = 0L
    
  if (usingMap) {  // 进行 map 端的合并
    estimatedSize = map.estimateSize()
    if (maybeSpill(map, estimatedSize)) { // 是否溢写
      // 发生溢写后,就会创建一个新的 map
      map = new PartitionedAppendOnlyMap[K, C]
    }
  } else {  // 不进行 map 端的合并
    estimatedSize = buffer.estimateSize()
    if (maybeSpill(buffer, estimatedSize)) { // 是否溢写
      // 进行溢写后,就会创建一个新的 buffer
      buffer = new PartitionedPairBuffer[K, C]
    }
  }

  // ...
}

maybeSpill() 的实现细节:

protected def maybeSpill(collection: C, currentMemory: Long): Boolean = {
  var shouldSpill = false
    
  if (elementsRead % 32 == 0 && currentMemory >= myMemoryThreshold) { // 已经操作阈值了
    // 从 Shuffle 内存池中,最多申请 currentMemory 的两倍
    // myMemoryThreshold 为内存阈值
    // 通过设置 spark.shuffle.spill.initialMemoryThreshold 参数来指定
    // 默认为 5 * 1024 * 1024
    val amountToRequest = 2 * currentMemory - myMemoryThreshold
    // 通过 TaskMemoryManager 来申请更多的内存
    val granted = acquireMemory(amountToRequest)
    // 提升阈值
    myMemoryThreshold += granted
    // 还是超过阈值,就需要溢写
    shouldSpill = currentMemory >= myMemoryThreshold
  }
  shouldSpill = shouldSpill || _elementsRead > numElementsForceSpillThreshold
  // 进行溢写
  if (shouldSpill) {
    _spillCount += 1
    logSpillage(currentMemory)
    // 真正的溢写操作
    spill(collection)
    _elementsRead = 0
    _memoryBytesSpilled += currentMemory
    releaseMemory()
  }
  shouldSpill
}

spill():

override protected[this] def spill(collection: WritablePartitionedPairCollection[K, C]): Unit = {
  // 在内存对 key 进行排序
  val inMemoryIterator = collection.destructiveSortedWritablePartitionedIterator(comparator)
  // 溢写到磁盘
  val spillFile = spillMemoryIteratorToDisk(inMemoryIterator)
  // 将溢写文件加到溢写磁盘中
  spills += spillFile
}

到接力 ExternalSorter.insertAll() 方法就算简单的剖析完了,接下来,我们看看 ExternalSorter.writePartitionedFile() 方法:

def writePartitionedFile(
    blockId: BlockId,
    outputFile: File): Array[Long] = {

  // Track location of each range in the output file
  val lengths = new Array[Long](numPartitions)
  // 获取 Writer
  val writer = blockManager.getDiskWriter(blockId, outputFile, serInstance, fileBufferSize,
    context.taskMetrics().shuffleWriteMetrics)

  if (spills.isEmpty) { 
    // 溢写文件集合为空,也就是没有溢写过
    val collection = if (aggregator.isDefined) map else buffer
    // 按分区和 key 排序后的数据迭代器
    val it = collection.destructiveSortedWritablePartitionedIterator(comparator)
    while (it.hasNext) {
      // 遍历分区 并写入
      val partitionId = it.nextPartition()
      while (it.hasNext && it.nextPartition() == partitionId) {
        it.writeNext(writer)
      }
      val segment = writer.commitAndGet()
      lengths(partitionId) = segment.length
    }
  } else {
    // 发生过溢写操作,需要将溢写文件进行合并
    // this.partitionedIterator 会将磁盘和内存中的数据合并到一起
    for ((id, elements) <- this.partitionedIterator ) {
      if (elements.hasNext) {
        for (elem <- elements) {
          writer.write(elem._1, elem._2)
        }
        val segment = writer.commitAndGet()
        lengths(id) = segment.length
      }
    }
  }
    
  // ...
    
  lengths
}

this.partitionedIterator 实现细节:

def partitionedIterator: Iterator[(Int, Iterator[Product2[K, C]])] = {
  val usingMap = aggregator.isDefined
  val collection: WritablePartitionedPairCollection[K, C] = if (usingMap) map else buffer
  if (spills.isEmpty) {
    // 这种情况我们不考虑
  } else {
    // 合并数据
    merge(spills, destructiveIterator(
      collection.partitionedDestructiveSortedIterator(comparator)))
  }
}

merge() 的实现细节:

private def merge(spills: Seq[SpilledFile], inMemory: Iterator[((Int, K), C)])
    : Iterator[(Int, Iterator[Product2[K, C]])] = {
  // 溢写文件的 reader
  val readers = spills.map(new SpillReader(_))
  val inMemBuffered = inMemory.buffered
  // 根据分区数进行迭代
  (0 until numPartitions).iterator.map { p =>
   // 当前分区的迭代器
    val inMemIterator = new IteratorForPartition(p, inMemBuffered)
   // 合并操作
    val iterators = readers.map(_.readNextPartition()) ++ Seq(inMemIterator)
    if (aggregator.isDefined) {
      // 需要 map 端聚合
      (p, mergeWithAggregation(
        iterators, aggregator.get.mergeCombiners, keyComparator, ordering.isDefined))
    } else if (ordering.isDefined) {
      // No aggregator given, but we have an ordering (e.g. used by reduce tasks in sortByKey);
      // sort the elements without trying to merge them
      (p, mergeSort(iterators, ordering.get))
    } else {
      (p, iterators.iterator.flatten)
    }
  }
}

合并操作我就不深入的剖析了。

简单的总结一下:

ShuffleMapTask 会根据不同的运行情况,选择不同的 Shuffle 写方式,我们以 SortShuffleWriter 为例。

SortShuffleWriter 在收到计算结果后,会根据是否进行 map 端聚合来实例化 ExternalSorter,然后,将计算结果通过 ExternalSorter.insertAll() 方法传递给 ExternalSorter 实例化对象中。

ExternalSorter 会根据是否需要进行 map 端聚合,对传递过来的数据进行不同形式的处理。如果在 map 端聚合,就在内存中进行聚合;如果不需要,就直接写入到内存缓存区中。

没插入完一条数据,都会进行是否需要溢写判断。如果达到阈值,ExternalSorter 并不会直接进行溢写操作,而是向 TaskMemoryManager 申请更多的内存,然后调整阈值。如果 TaskMemoryManager 无法分配足够多的内存时,才会进行溢写,每次溢写都会产生一个新文件,并重新创建容器(map / buffer)。

在完成 insertAll() 操作后,就会将各个分区数据写入到临时文件(就一个)中了。

写入的时候也分两种情况,如果没有产生过溢写文件,也就是数据全在内存中,就会将数据按照分区和 key 进行排序,然后依次写入到临时文件中;如果产生过溢写文件,就会按照分区进行迭代,然后遍历溢写文件,合并这个分区的数据,最后写入到临时文件中。

最后一步,就是创建索引文件,记录各个块的偏移量和结束的位置,Shuffle Reader 进行读的时候,可以直接调用 getBlockData() 方法进行读取。

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