124:Pinnacle21验证数据集实操

今天试了一下用Pinnacle21验证SDTM数据集,发现很简单,只要几分钟就好了。

101:SAS生成XPT格式文件

上次我讲了如何用SAS导出XPT格式的文件,然后我今天去官网找这个宏,我去!发现这个宏更新了,直接给你写成一个循环,而不是只有一个宏介绍。



我直接把代码copy下来,设定好自己的逻辑库,立马把所有的数据集都转换成XPT格式的文件。


接着将XPT文件导入到Pinnacle里面(目前P21暂不接受.sas的文件格式),点击Validate,等一会儿就可以查看报告了。

我们选择FDA,你要验证SDTM数据集就选择SDTM,验证ADaM数据集就选择ADaM,目前NMPA只有SDTMig3.2选项,我就不选了,感兴趣的你们自己可以导出看看。

之后直接将你的XPT文件导入进来

你可以根据报告看看你创建的数据集有什么问题,然后进行相应的修改。但是并不是P21显示的所有问题你都要修改。

报告主要看“ISSUE SUMMARY”,里面是具体数据集有哪些问题:

像这种控制术语的问题,因为local项目的话,CT是用中文,这个就没必要改了。

detail sheet就更详细了,具体到你的数据集哪个观测出现了问题。

rules sheet列举了你出的问题违反了哪个rules,如果闲的蛋疼的话,可以没事就看看这些rules,说不定你写SPEC就能避免犯这些错。

就这样了,接下来就是根据报告修改SPEC,修改数据集了。

注意的是:目前Pinnacle21注册只能用公司邮箱,个人的邮箱,像XX是不行的啊!

下面附上SAS官网的代码

libname sdtm 'D:\A_WORK\Practice\dataset';

proc sql;

   create table sdtmDomains as

      select libname

            ,memname

      from dictionary.tables

         where libname eq 'SDTM'

      order by memname;

quit;

data _null_;

   set sdtmDomains end=eof;

   call symput('domain_' || strip(put(_n_,2.))

              ,strip(lowcase(memname))

              );

   if eof then 

      call symput('domainCnt',strip(put(_n_,2.)));

run;

%macro xpt;

   %do idx=1 %to &domainCnt;

   filename xptfile "D:\A_WORK\Practice\xpt\&&domain_&idx...xpt";

      %loc2xpt(libref=sdtm

              ,memlist=&&domain_&idx

              ,filespec=xptfile

              );

   %end;

%mend xpt;

%xpt

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