linux环境下的软件安装
- miniconda安装和配置
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miniconda安装:清华大学镜像站安装 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
minicoda配置
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激活并添加镜像:Linux中复制粘贴是鼠标左键和右键
- 应用miniconda进行基础操作
- 查看当前所有软件列表 conda list
- 搜索软件 conda search fastqc
- 安装软件 conda install fastqc -y
- 卸载软件 conda remove fastqc -y
- conda 环境
- 查看当前conda:conda info --envs
- 建立名叫rnaseq的conda环境,指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic: conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
- 删除非空目录--rm -r(有空格)
- 激活新的conda 环境