题目:Molecular Fingerprint for Terminal Abdominal Aortic Aneurysm Disease
DOI: 10.1161/JAHA.117.006798
数据集: GSE98278
样本:
eAAA: 31
rAAA: 17
分析方法:
DEG: R((|log 2 fold change - [FC]| ≥1.5, adjusted P<0.05)
Ingenuity Pathway Analysis : 上游调控因子的分析
IHC/RT-PCR:验证差异基因
文章数据:
1.实验设计及差异基因火山图（破裂vs稳定，中等vs大）
2.标本的病人信息
3.验证的基因列表
4.破裂vs稳定AAA上调、下调差异基因列表
5.中等vs大AAA上调、下调差异基因列表
6.候选基因的在不同组的表达水平
7.验证与AAA破裂和尺寸变化相关的5个基因
8.验证与AAA size无关的候选基因表达情况
9.AAA独有的差异基因表达情况
10.IHC验证候选基因
11.破裂AAA中新生血管情况
12.上游调控因子分析结果
13.破裂AAA与HIF-1a密切相关
14.EndoMT过程中HIF-1a表达
