[论文笔记]Learning Convolutional Neural Networks for Graphs

Learning Convolutional Neural Networks for Graphs (2016 ICML)
ppt讲解

[概要]

对于图像images来说,CNN对输入image的局部关联的区域进行操作,与此类似,本文提出了一种通用的方法,也抽取graph中局部关联的区域进行相应的操作。
由于images是排列成grid形状,所以images可以直接运用卷积操作。但是对于图结构来说,需要一个从graph到向量的映射的一个预处理过程
作者提出了对任意的图学习卷积神经网络的框架:PATCHY-SAN(Select-Assemble-Normalize)。通过三个步骤构建卷积分片:

  1. 从图中选择一个固定长度的节点序列;
  2. 对序列中的每个节点,收集固定大小的邻居集合;
  3. 对由当前节点及其对应的邻居构成的子图进行规范化,作为卷积结构的输入。

通过上述三个步骤构建出所有的卷积片之后,利用卷积结构分别对每个分片进行操作。
图结构:可以是有向图,也可以是无向图;图可以有多种类型的边;图的点或边的特征,可以同时有多个离散和连续的特征。

[应用]

将 CNNs 拓展到大规模的基于 graph 的学习问题中,主要考虑两类问题:

  • 给定一组 graphs,学习一个函数,使之可以对 unseen graphs 用于 classification 或者 regression problem
  • 给定一个大型的 graph,学习 graph 的表示,使其可以用于推理不可见的 graph 属性,例如:node types 或者 missing edges

[算法]

1. 节点序列选择[Node Sequence Selection]
  • graph labeling: labeling算法用来确定一个graph中node的次序。这个算法可以是centrality的测量方式,比如:between centrality, Weisfeiler-Lehman algorithm, 或者其他你认为可行的算法。由此可以得到每个节点的rank 值(为了不同的图能够有一个规范化的组织方式)
  • 从该序列中根据一定的间隔s隔段选取w个节点构成最终的节点序列。对每个访问的点,生成一个receptive field, 直到生成w个receptive fields。若不足w个节点,则,在输出中加全零的receptive field,相当于padding
    figure 1.jpg
2. 邻居节点收集[Neighborhood Assembly]

对于上一步获得的节点序列中的每一个节点,利用广度优化搜索扩展邻居节点,和源节点一起构成一个至少k大小的邻域集合。

3. 图规范化[Graph Normalization]

figure 2.png

使用NAUTY, 对邻域集合用标号函数进行排序, 得到大小为的接受域。

4. 卷积结构[Convolutional Architecture]

对于节点的属性,k个节点属性值构成了一个输入通道,对于边的属性,k^2个属性值也构成了一个输入通道。我们可以分别用一维的卷积层来处理这两种输入通道(对于节点属性卷积层长度为k,对于边属性卷积层长度为k^2)。

[贡献] Theoretical Contributions

  • the definition of the normalization problem on graphs and its complexity;
  • a method for comparing graph lebaling approaches for a collection of graphs;
  • a result that shows PATCHY-SAN generalizes CNNs on images.

[优缺点] Pros/Cons

Advantages

  • Graph kernel design not required
  • Outperforms graph kernels on several datasets (speed and accuracy)
  • Incorporates node and edge features (discrete and continuous)
  • Supports visualizations (graph motifs, etc.)

Disadvantages

  • Prone to overfitting on smaller data sets (graph kernel benchmarks)
  • Shift from designing graph kernels to tuning hyperparameters
  • Graph normalization not part of learning

[实验及结果分析]

Date Sets

6 standard benchmark data sets: MUTAG, PCT, NCI1, NCI109, PROTEIN, D&D.

Experimental Set-up

PSCN vs state-of-the-art graph kenerls: SP, RW, GK, WL

Reference:

  1. 论文笔记:Learning Convolutional Neural Networks for Graphs
  2. 论文笔记 |Learning Convolutional Neural Networks for Graphs
  3. 深度学习在graph上的使用
  4. 论文引介 |Learning Convolutional Neural Networks for Graphs4
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