Spark UnsafeShuffleWriter写流程分析

Spark的UnsafeShuffleWriter是Tungsten-Project(内存管理)引入的新的Shuffle Writer。
该writer在写数据到磁盘时,会将数据有序写入(仅仅分区间有序,分区内无序)。 本文主要介绍其写数据实现,并讨论其缓存友好设计及实现。以下介绍其相关实现:

UnsafeShuffleWriter的实现

写数据相关类

各函数类的职责:

UnsafeShuffleWriter : 数据写的入口,并将最后内存数据以及spill至磁盘的数据读取并以分区merge后再次写入磁盘
ShuffleExternalSorter :内存申请,管理,写入数据至内存页,代理ShuffleInMemorySorter的写入
ShuffleInMemorySorter : 将分区号及数据指针写入LongArray

其核心流程主要包括如下:

  1. 将输入数据(record)遍历
  2. 分区号数据指针写入ShuffleInMemorySorter的array:LongArray,序列化的数据写入page页
  3. 如果其中内存不足时,会将序列化数据根据分区号spill至磁盘
  4. 数据操作完毕后,将当前内存中的数据以及spill至磁盘的数据重新merge,按分区号排序写如磁盘。

UnsafeShuffleWriter 遍历数据

核心代码逻辑如下:

public void write(scala.collection.Iterator<Product2<K, V>> records) throws IOException {
    boolean success = false;
    try {
      while (records.hasNext()) {
          // 插入数据
        insertRecordIntoSorter(records.next());
      }
      // 将内存数据及spill之后的数据重新merge并写入磁盘,同时也生成index文件
      closeAndWriteOutput();
      success = true;
    } finally {
      ...
    }
  }

其中insertRecordIntoSorter实现如下:

void insertRecordIntoSorter(Product2<K, V> record) throws IOException {
    assert(sorter != null);
    // 将key,value写入serBuffer
    final K key = record._1();
    final int partitionId = partitioner.getPartition(key);
    serBuffer.reset();
    serOutputStream.writeKey(key, OBJECT_CLASS_TAG);
    serOutputStream.writeValue(record._2(), OBJECT_CLASS_TAG);
    serOutputStream.flush();

    final int serializedRecordSize = serBuffer.size();
    // 调用ShuffleExternalSorter的insertRecord方法插入数据
    sorter.insertRecord(
      serBuffer.getBuf(), Platform.BYTE_ARRAY_OFFSET, serializedRecordSize, partitionId);
  }

调用ShuffleExternalSorter的insertRecord的方法存入数据及分区号,数据指针,主要包含以下步骤:

  1. 如果空间不足,将触发spill落盘
  2. 申请LongArray用于存储partitionId和指针
  3. 当前page也不足以缓存数据时,申请新page页
  4. 将数据存入缓存页
  5. 缓存指针和partitionId
public void insertRecord(Object recordBase, long recordOffset, int length, int partitionId)
    throws IOException {
    if (inMemSorter.numRecords() >= numElementsForSpillThreshold) {
      logger.info("Spilling data because number of spilledRecords crossed the threshold " +
        numElementsForSpillThreshold);
      // 1. 如果存储空间不足,则触发spill操作
      spill();
    }
    // 2. 申请LongArray用于存储partitionId和指针
    growPointerArrayIfNecessary();
    // Need 4 bytes to store the record length.
    final int required = length + 4;
    // 3. 为缓存数据 获取申请新page页
    acquireNewPageIfNecessary(required);

    final Object base = currentPage.getBaseObject();
    final long recordAddress = taskMemoryManager.encodePageNumberAndOffset(currentPage, pageCursor);
    Platform.putInt(base, pageCursor, length);
    pageCursor += 4;
    // 4. 将数据存入page中
    Platform.copyMemory(recordBase, recordOffset, base, pageCursor, length);
    pageCursor += length;
    // 5. 将数据指针和partitionId写入inMemSorter中的Array中
    inMemSorter.insertRecord(recordAddress, partitionId);
  }

spill数据

核心调用关系:ShuffleExternalSorter.spill -> ShuffleExternalSorter.writeSortedFile(false).
其核心实现逻辑是:

  1. 根据分区id对inMemSort中的数据LongArray的进行排序
  2. 根据排序好的LongArrary中数据找出对应的真实数据对应的page页及在该页的位置,也就是找出真实数据
  3. 将数据落盘

writeSortedFile 方法实现如下:

 private void writeSortedFile(boolean isLastFile) {
        //...
        // This call performs the actual sort.
        // 将数据跟分区号排序
    // This call performs the actual sort.
    final ShuffleInMemorySorter.ShuffleSorterIterator sortedRecords =
      inMemSorter.getSortedIterator();
    // 用于存放spill信息
    final SpillInfo spillInfo = new SpillInfo(numPartitions, file, blockId);
    // 创建writer
    final DiskBlockObjectWriter writer =
      blockManager.getDiskWriter(blockId, file, ser, fileBufferSizeBytes, writeMetricsToUse);

    int currentPartition = -1;
    final int uaoSize = UnsafeAlignedOffset.getUaoSize();
    while (sortedRecords.hasNext()) {
      sortedRecords.loadNext();
      // 计算数据分区号
      final int partition = sortedRecords.packedRecordPointer.getPartitionId();
      assert (partition >= currentPartition);
      if (partition != currentPartition) {
        // Switch to the new partition
        if (currentPartition != -1) {
          final FileSegment fileSegment = writer.commitAndGet();
          spillInfo.partitionLengths[currentPartition] = fileSegment.length();
        }
        currentPartition = partition;
      }
        //通过指针(page页及offset)计算数据地址
      final long recordPointer = sortedRecords.packedRecordPointer.getRecordPointer();
      final Object recordPage = taskMemoryManager.getPage(recordPointer);
      final long recordOffsetInPage = taskMemoryManager.getOffsetInPage(recordPointer);
      int dataRemaining = UnsafeAlignedOffset.getSize(recordPage, recordOffsetInPage);
      long recordReadPosition = recordOffsetInPage + uaoSize; // skip over record length
      //// 将数据通过writer写出, 由于可能使用zero copy技术,每次数据写入字节数有限制,因此此处使用循环调用
      while (dataRemaining > 0) {
        final int toTransfer = Math.min(diskWriteBufferSize, dataRemaining);
        Platform.copyMemory(
          recordPage, recordReadPosition, writeBuffer, Platform.BYTE_ARRAY_OFFSET, toTransfer);
        writer.write(writeBuffer, 0, toTransfer);
        recordReadPosition += toTransfer;
        dataRemaining -= toTransfer;
      }
      writer.recordWritten();
    }
    final FileSegment committedSegment = writer.commitAndGet();
    writer.close();
    if (currentPartition != -1) {
      spillInfo.partitionLengths[currentPartition] = committedSegment.length();
      spills.add(spillInfo);
    }
    ...
  }

为LongArray申请内存空间

当LongArray剩余空间不足以满足新增数据时,会对LongArary扩容,扩容会会将原有LongArray中的数据copy至新的Array中,并释放源有LongArray

  private void growPointerArrayIfNecessary() throws IOException {
    assert(inMemSorter != null);
    if (!inMemSorter.hasSpaceForAnotherRecord()) {
      long used = inMemSorter.getMemoryUsage();
      LongArray array;
      try {
        // could trigger spilling  // 申请内存空间
        array = allocateArray(used / 8 * 2);
      } catch (OutOfMemoryError e) { //...
        }
        return;
      }
      // check if spilling is triggered or not
      if (inMemSorter.hasSpaceForAnotherRecord()) {
        freeArray(array);
      } else {
        // 完成扩容后的老数据迁移
        inMemSorter.expandPointerArray(array);
      }
    }
  }

申请内存页用户存放真实数据

如果currentPage为空或者currentPage不足以存放数据时,则重新申请缓存page,并将其设置为currentPage. 内存页的申请,我们后续单独讨论

 private void acquireNewPageIfNecessary(int required) {
    if (currentPage == null ||
      pageCursor + required > currentPage.getBaseOffset() + currentPage.size() ) {
      // TODO: try to find space in previous pages
      currentPage = allocatePage(required);
      pageCursor = currentPage.getBaseOffset();
      allocatedPages.add(currentPage);
    }
  }

数据写入page页

  1. 先将数据长度写入page页
  2. 将真实数据写入page页
    final Object base = currentPage.getBaseObject();
    // 先放入长度,占用4个字节
    Platform.putInt(base, pageCursor, length);
    pageCursor += 4;
    //放入真实的数据, 占用length个字段
    Platform.copyMemory(recordBase, recordOffset, base, pageCursor, length);
    pageCursor += length;

将分区id,page页数,page页的offset写入LongArray

调用inMemSorter.insertRecord(recordAddress, partitionId)方法完成,本质是放入LongArray数组中

public void insertRecord(long recordPointer, int partitionId) {
    if (!hasSpaceForAnotherRecord()) {
      throw new IllegalStateException("There is no space for new record");
    }
    array.set(pos, PackedRecordPointer.packPointer(recordPointer, partitionId));
    pos++;
  }

缓存友好/感知及其实现

CPU从高速缓存中读取数据的效率与从内存中读取数据的效率相差较大。从高速缓存读取数据的性能是内存中读取数据的几十倍上百倍。缓存友好/感知的含义是指CPU访问数据时,更多/更高概率的从高速缓存中(L1,L2,L3级缓存效率依次递减)命中数据,此时CPU的数据读取性能更好。在大批量数据处理时,如果能够提升高速缓存命中的概率,则可以显著提升应用运行性能。

在Spark的Tungsten-Project的内存管理中就对提升数据的缓存做了优化,极大提升了在高速缓存中被命中的概率。通常情况下,计算机的缓存空间较小,如果将整条数据都进行缓存,则有缓存数据的记录数就很少。因此Spark采用只缓存记录的部分关键字段/信息的方式。

缓存友好的实现

Spark在内存中inMemSort中使用一个LongArray来保存每条每条记录的partitionId和该记录的指针,其中partitionId用于对记录进行分区排序,记录的指针用于指向数据的地址,通过指针可以访问到该数据。因此只需要在LongArray中放入一个long型数据,即可同时存放partitionId和数据地址

LongArray设计

LongArray中存储的数据的结构如下:

从上图可以看出,有24个bit位用于存放分区号,这也是为什么使用UnsafeShuffleWriter需要保证分区数小于2^24
从上图可以看出page页使用13个bit位表示因此可以推算出 page页不能多于2^13
从上图可以offset使用的是27个bit位,也就是单个page也不能存储超过其所能存储的数据

在将数据spill磁盘时,我们只需要对LongArray中的记录进行排序(每个记录中都包含该一个真实数据的partitionId和指向该数据的地址指针),有序(基于分区号有序)的LongArray的顺序访问即可保证读取的page也中的数据是有序的。

基于分区的排序

有了上图中的设计之后,我们就可以做到:

无序访问真实的数据,仅仅通过访问LongArray中的数据即可完成基于分区的排序

在高速缓存中不用缓存真实数据(一般远远大于LongArray中存储的一个long型数据),仅仅缓存LongArray(包括分区号,真实数据的地址指针),极大提升了高速缓存命中率,加速了排序过程

从以上分析可以看出,此处的实现结合了计算机硬件的设计,高效利用硬件,完成了程序的性能提升。如果没有该设计,那么在对数据spill的过程中,在数据量较大的情况下,由于无法对大量数据进行高速缓存,与以上方案相比,性能应当有明显的降低。

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